OTAR3088/CeLLaTe-V1-cleaned-split · Datasets at Hugging Face

tokens listlengths 2 311	tags listlengths 2 311
[ "It", "could", "be", "suggested", "that", "an", "incubation", "time", "of", "6", "h", "is", "too", "short", ",", "but", "due", "to", "the", "short", "half-life", "of", "angiotensin", "II", ",", "longer", "exposure", "times", "would", "likely", "not", "result", "in", "more", "relevant", "data", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "On", "cellular", "gene", "promoters", "such", "as", "the", "three", "genes", "mentioned", "above", ",", "it", "is", "conceivable", "that", "transcription", "can", "also", "be", "modulated", "through", "controlling", "the", "function", "and/or", "binding", "of", "the", "PRMT3-TEAD4", "complex", "to", "the", "GGAAT", "motif", "in", "response", "to", "changes", "in", "physiological", "or", "pathological", "conditions", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "upregulation", "of", "PD-L1", "in", "response", "to", "IFN-γ", "was", "confirmed", "at", "both", "the", "mRNA", "and", "protein", "levels", ",", "as", "demonstrated", "by", "qRT-PCR", "and", "Western", "blotting", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "level", "of", "p", " ", "", "", "", "Results", "", "", "", "Discussion", "The", "host", "immune", "system", "exerts", "immunosurveillance", "to", "control", "cancer", "development", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Tissue", "I-Tissue", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Glycosylated", "stilbene", "scaffolds", "have", "great", "potential", "for", "therapeutic", "applications", ",", "so", "further", "studies", "are", "needed", "to", "assess", "the", "bioactive", "potential", "of", "resveratroloside", "(", "1", ")", "and", "pinostilbenoside", "(", "2", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Notably", ",", "the", "biological", "complexity", "of", "tumor", "microenvironments", ",", "such", "as", "gene", "expression", "variability", ",", "signaling", "heterogeneity", ",", "immune", "interactions", ",", "and", "stromal", "influences", ",", "can", "not", "be", "adequately", "mimicked", "using", "isolated", "cell", "lines", "like", "HeLa", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "B-CellLine", "O" ]
[ "Then", ",", "we", "performed", "anti-Flag", "ChIP-qPCR", "in", "cells", "transfected", "with", "the", "sgLTRs-dCas9", "-", "3", " ", "×", " ", "Flag", "plasmids", "to", "further", "verify", "the", "abilities", "of", "the", "sgLTRs", "to", "target", "dCas9", "-", "3", " ", "×", " ", "Flag", "to", "the", "LTR", ",", "and", "found", "that", "sgLTR-1", "and", "-2", "failed", "to", "recruit", "dCas9", "to", "LTR", "efficiently", "(", "Supplementary", "Fig.", " ", "1a", ",", "b", ")", ",", "sgLTR-5", "and", "-6", "displayed", "the", "most", "significant", "effect", ",", "whereas", "sgLTR-3", ",", "-4", "and", "-7", "all", "displayed", "a", "similar", "and", "partial", "effect", "(", "Supplementary", "Fig.", " ", "1c", ",", "d", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Thus", ",", "the", "concentrations", "of", "the", "vasodilator", "angiotensin", "(", "1", "-", "7", ")", "formed", "by", "protease", "ACE2", "may", "be", "higher", ",", "and", "through", "its", "interaction", "with", "receptor", "MAS1", ",", "anti-angiogenic", "and", "anti-inflammatory", "processes", "can", "be", "induced", "(", "24", "-", "27", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "For", "comparison", "of", "RT-qPCR", "signals", "from", "treated", "cells", "to", "the", "hypothetical", "value", "of", "1", "(", "normalized", "to", "the", "signal", "of", "control", "cells", ")", ",", "a", "one-sample", "t-test", "was", "used", ",", "as", "in", "this", "type", "of", "statistical", "analysis", ",", "the", "variability", "of", "the", "values", "obtained", "from", "control", "cell", "signals", "is", "taken", "into", "consideration", ",", "although", "they", "appear", "without", "standard", "deviations", "(", "SD=0", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Bivalent", "SMs", "are", "more", "effective", "than", "their", "monovalent", "counterparts", ",", "probably", "because", "of", "the", "presence", "of", "dimers", "that", "may", "contribute", "to", "a", "more", "stable", "and", "enhanced", "activation", "via", "interactions", "with", "the", "two", "adjacent", "binding", "domains", "of", "IAPs.52", "Among", "the", "bivalent", "SMs", "we", "examined", ",", "APG-1387", "is", "most", "effective", "at", "degrading", "IAPs", ",", "facilitating", "a", "conversion", "of", "NFKB", "p100", "to", "p52", ",", "and", "reactivating", "HIV", "expression", "through", "an", "NIK-dependent", "process", ",", "a", "hallmark", "of", "an", "activated", "non-canonical", "NFKB", "pathway.23,24", "In", "CD4", "+", "T", " ", "cell", "models", "of", "HIV", "latency", ",", "APG-1387", "treatment", "is", "associated", "with", "remarkable", "viral", "reactivation", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Recently", ",", "interest", "in", "the", "role", "of", "PCYT2", "in", "cancer", "has", "been", "growing", "[", "18,23,24", "]", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Given", "the", "documented", "cytotoxic", "activity", "of", "the", "DCM", "extract", "from", "the", "related", "subspecies", "A.", "rugosa", "[", "8", "]", ",", "we", "hypothesized", "that", "A.", "incana", "might", "exhibit", "similar", "effects", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "This", "effect", "has", "been", "supported", "by", "biochemical", "purifications", "of", "HIV-1", "Tat", "from", "human", "cell", "lines", "that", "revealed", "interactions", "with", "a", "larger", "SEC", "[", "41,42", "]", ",", "as", "well", "as", "by", "genetic", "knock-down", "experiments", "in", "cell", "lines", "showing", "a", "decrease", "in", "Tat-dependent", "transcription", "upon", "SEC", "component", "depletion", "[", "64,65", "]", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "IL-8", "is", "a", "well-characterized", "ELR+", "CXC", "chemokine", "that", "attracts", "neutrophils", "through", "binding", "CXCR1", "and", "CXCR2", "receptors", "on", "the", "cell", "surface", "[", "47", "]", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Rna", "sequencing", "analysis", "Sequencing", "data", "was", "demultiplexed", "and", "trimmed", "using", "Trimmomatic", "v0.36", "to", "remove", "adapters", "and", "low-quality", "reads", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Both", "display", "key", "steps", "of", "gene", "transcription", ",", "which", "include", "initiation", ",", "promoter", "arrest", ",", "and", "elongation", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "this", "study", ",", "we", "found", "that", "in", "normal", "DNA-PK", "glioblastoma", "M059", "K", "cell", "lines", ",", "knockdown", "of", "MYT1L", "attenuated", "cell", "proliferation", "and", "induced", "apoptosis", "and", "S-phase", "cell", "cycle", "arrest", "(", "Figure", "1A", "–", "D", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Tissue", "B-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Thus", ",", "in", "addition", "to", "PRMT3", ",", "other", "members", "of", "the", "PRMT", "family", "should", "be", "explored", "as", "potential", "targets", "for", "developing", "effective", "antiviral", "drugs", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Further", "in-depth", "mechanistic", "studies", ",", "along", "with", "rigorous", "in", "vivo", "evaluations", "using", "clinically", "relevant", "models", "such", "as", "patient-derived", "xenografts", ",", "are", "essential", "to", "validate", "these", "promising", "findings", "and", "fully", "realize", "the", "clinical", "potential", "of", "this", "natural", "fraction", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "T-test", "was", "performed", "to", "determine", "the", "significant", "of", "differences", "between", "two", "groups", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "discussion", "Cell", "surface", "receptors", "and", "their", "coupled", "intracellular", "signaling", "pathways", "have", "been", "intensively", "studied", "in", "many", "physiological", "and", "pathological", "processes", "over", "five", "decades", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "A", "trend", "toward", "a", "decrease", "was", "also", "observed", "in", "response", "to", "sustained", "high-glucose", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Results", "Discussion", "In", "this", "study", ",", "we", "demonstrate", "a", "potential", "new", "strategy", "for", "enhancing", "HIV-1", "latency", "reversal", "through", "the", "release", "of", "P-TEFb", "from", "the", "cellular", "pool", "of", "SECs", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "are", "aware", "that", "the", "model", "of", "stimulated", "CD4", "+", "primary", "cells", "does", "not", "recapitulate", "the", "actual", "state", "of", "the", "reservoir", ",", "which", "is", "mainly", "comprise", "of", "resting", "CD4", "+", "T", "cells", "that", "do", "not", "support", "HIV", "infection", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Here", ",", "we", "discovered", "that", "MYT1L", "could", "directly", "regulate", "the", "transcription", "of", "CXCR1", "through", "a", "novel", "cis-acting", "element", "(", "−2114/−2103", ")", "at", "the", "CXCR1", "promoter", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "DNA-PK", "inhibited", "the", "transcription", "of", "the", "xanthine", "oxidoreductase", "gene", "via", "E-box/TATA-like", "elements", "[", "44", "]", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Cisplatin", "exerts", "its", "cytotoxic", "effects", "primarily", "through", "DNA", "cross-linking", ",", "causing", "extensive", "DNA", "damage", "that", "leads", "predominantly", "to", "G2/M", "cell", "cycle", "arrest", "and", "subsequent", "apoptosis", "induction", "mainly", "via", "p53-dependent", "pathways", "[", "24", ",", "25", "]", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Antigens", "must", "be", "processed", "into", "antigenic", "peptides", "by", "APM", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "statistical", "analysis", "The", "Student", "’s", "t-test", "was", "used", "to", "determine", "the", "statistical", "significance", "of", "differences", "in", "GROα", "expression", ",", "IL-8", "expression", ",", "cell", "growth", ",", "apoptosis", ",", "cell", "cycle", ",", "and", "luciferase", "activity", "between", "groups", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Although", "one", "of", "the", "most", "well-defined", "functions", "of", "DNA-PK", "is", "to", "govern", "the", "repair", "of", "DNA", "double-strand", "breaks", "through", "both", "non-homologous", "end-joining", "(", "NHEJ", ")", "and", "homologous", "recombination", "(", "HR", ")", "[", "42", "]", ",", "it", "was", "originally", "identified", "as", "a", "component", "of", "the", "Sp1", "transcription", "complex", "in", "which", "it", "may", "modulate", "the", "transcriptional", "activity", "of", "the", "complex", "by", "phosphorylating", "Sp1", "[", "43", "]", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "addition", ",", "the", "effects", "of", "other", "stressors", ",", "such", "as", "oxidative", "stress", "or", "hypoxia", ",", "which", "also", "play", "a", "role", "in", "diabetic", "retinal", "damage", ",", "were", "not", "included", "in", "our", "model", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "P-TEFb", "phosphorylates", "the", "C-terminal", "tail", "of", "RNA", "Pol", "II", "and", "several", "negative", "elongation", "factors", ",", "which", "collectively", "license", "transcriptional", "elongation", "[", "22–24", "]", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "blots", "were", "stripped", "before", "reprobing", "with", "an", "antibody", "against", "actin", "(", "Abcam", ",", "Cambridge", ",", "GH", ",", "UK", ")", "or", "GAPDH", "(", "Santa", "Cruz", "Biotechnology", ",", "Dallas", ",", "TX", ",", "USA", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Cells", "were", "then", "lysed", "for", "10", "minutes", "on", "ice", "in", "130μl", "sonication", "buffer", "(", "20", "mM", "Tris", "pH-7.8", ",", "2", "mM", "EDTA", ",", "0,5", "%", "SDS", ",", "0.5", "mM", "phenylmethylsulfonyl", "fluoride", "(", "PMSF", ")", ",", "and", "1", "%", "protease", "inhibitor", "cocktail", ")", ",", "and", "the", "nuclear", "pellets", "were", "collected", "." ]	[ "B-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "saponifiable", "fraction", "presented", "a", "balanced", "composition", "of", "saturated", "(", "48.69", "%", ")", "and", "unsaturated", "(", "51.29", "%", ")", "fatty", "acids", ",", "with", "palmitic", "acid", ",", "linolenic", "acid", ",", "and", "linoleic", "acid", "as", "the", "predominant", "compounds", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Besides", ",", "it", "was", "shown", "in", "this", "study", "that", "Endostar", "inhibited", "HIF-1", "with", "upregulation", "of", "MHC", "class", "I", "expression", "in", "A549", "and", "NCI-H1299", "lung", "cancer", "cells", ",", "benefiting", "cancer", "cell", "killing", "by", "effectory", "lymphocytes", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "B-CellType", "O", "O", "O", "B-CellType", "O" ]
[ "In", "contrast", ",", "HG", "MIO-M1", "cells", "maintain", "a", "basal", "high", "level", "of", "both", "GFAP", "and", "Vimentin", "together", "to", "less", "organized", "intermediate", "filaments", "across", "the", "different", "glucose", "treatments", ",", "suggesting", "a", "limited", "and", "static", "response", "to", "sustained", "high-glucose", "and", "GF", "treatments", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Tissue", "I-Tissue", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Therefore", ",", "a", "better", "understanding", "of", "the", "key", "players", "in", "the", "signaling", "pathways", "may", "offer", "opportunities", "for", "therapeutic", "intervention", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Research", "on", "the", "antitumor", "potential", "(", "mechanisms", "underlying", "cytotoxic", "activity", "in", "HeLa", "cells", ",", "cytotoxicity", "against", "other", "tumor", "cell", "lines", ")", "should", "also", "continue", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "enforced", "expression", "of", "MYT1L", "caused", "an", "elevation", "of", "GROα", "in", "HEK293", "and", "M059J", "cells", "(", "Figure", "4B", "–", "E", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "study", "employed", "the", "MIO-M1", "cell", "line", ",", "which", ",", "although", "well", "established", "in", "human", "retinal", "research", ",", "may", "not", "fully", "capture", "the", "physiological", "complexity", "of", "Müller", "cells", "found", "in", "human", "retina", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "B-Tissue", "O" ]
[ "F-actin", "was", "visualized", "with", "tetramethyl", "rhodamine", "isothiocyanate", "(TRITC)-conjugated", "phalloidin", "(", "1:1,000", ",", "1", "hour", ",", "room", "temperature", ";", "Sigma", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "However", ",", "in", "mammals", ",", "the", "SHH", "pathway", "alone", "may", "not", "be", "sufficient", "to", "overcome", "the", "intrinsic", "limitations", "of", "Müller", "cells", "to", "regenerate", "neuronal", "cells", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O" ]
[ "This", "failure", "is", "partly", "due", "to", "the", "latent", "reservoir", "’s", "heterogenous", "nature", ",", "such", "that", "treatment", "by", "a", "single", "agent", "that", "acts", "to", "target", "a", "specific", "block", "may", "only", "ever", "reactivate", "a", "small", "fraction", "of", "proviruses", "in", "vivo", "[", "10", "]", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "These", "may", "open", "new", "ways", "for", "developing", "novel", "therapeutic", "tools", "that", "will", "be", "integrated", "or", "substitute", "current", "strategies", "to", "successfully", "eliminate", "the", "HIV", "reservoir", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "SOCS1", "is", "known", "to", "act", "as", "a", "feedback", "inhibitor", "of", "JAK-STAT", "signaling", "(", "Liau", "et", "al.", "2018", ")", ",", "but", "paradoxically", ",", "its", "overexpression", "in", "tumors", "has", "been", "associated", "with", "immune", "escape", "mechanisms", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "These", "observations", "underscore", "the", "notion", "that", "glial", "cells", ",", "including", "Müller", "cells", "and", "astrocytes", ",", "exhibit", "differential", "SHH", "responses", "depending", "on", "the", "extent", "of", "glucose", "stress", ",", "highlighting", "the", "dynamic", "regulation", "of", "SHH", "signaling", "in", "glial", "cells", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "B-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O" ]
[ "To", "assess", "a", "possible", "pro-inflammatory", "response", "of", "Mueller", "cells", ",", "the", "changes", "in", "the", "expression", "of", "mRNA", "as", "well", "as", "secretion", "of", "the", "pro-inflammatory", "cytokine", "IL-6", ",", "which", "is", "constitutively", "expressed", "by", "this", "cell", "type", "(", "including", "MIO-M1", "cells", ")", ",", "was", "assessed", "(", "31", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "bark", "[", "45", "]", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Our", "findings", "have", "demonstrated", "a", "positive", "feedback", "DNA-PK/MYT1L-CXCR1-ERK1/2", "proliferative", "signaling", "loop", "in", "glioblastoma", "cells", "and", "might", "have", "significant", "therapeutic", "implications", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Therefore", ",", "Endostar", "has", "anti-angiogenesis", "effects", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Epigenetic", "constraints", "that", "suppress", "proviral", "gene", "transcription", "are", "essential", "for", "establishing", "HIV", "latency", "[", "16,17", "]", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "P#x003C;0.05", "was", "considered", "to", "indicate", "a", "statistically", "significant", "difference", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Multifaceted", "and", "heterogenous", "blocks", "to", "viral", "gene", "expression", "establish", "and", "maintain", "HIV-1", "latency", "at", "the", "epigenetic", ",", "transcriptional", ",", "and", "post-transcriptional", "levels", "[", "2", "]", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "antioxidant", "potential", "of", "the", "raw", "bark", "extract", "is", "strongly", "associated", "with", "the", "total", "phenolic", "content", ",", "quantified", "as", "299.3", "±", "1.4", "mg/g", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "results", "are", "consistent", "with", "previous", "studies", "on", "the", "antitumor", "potential", "of", "stilbenes", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "MHC", "class", "I", "molecules", "are", "glycoproteins", "of", "heterodimers", "with", "a", "polymorphic", "heavy", "chain", "(", "α-chain", ")", "and", "an", "invariable", "β2", "microglobulin", "(", "β2", " ", "m", ")", "light", "chain", "(", "β-chain", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Immunofluorescence", "analysis", "confirmed", "that", "IFN-γ", "treatment", "led", "to", "a", "marked", "accumulation", "of", "p-STAT1", "in", "the", "nucleus", ",", "reinforcing", "the", "notion", "that", "STAT1", "plays", "a", "crucial", "role", "in", "IFN-γ-mediated", "transcriptional", "regulation", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Endostar", ",", "an", "N-terminal", "modified", "recombinant", "human", "endostatin", ",", "is", "a", "human", "recombinant", "endostatin", ",", "an", "attractive", "anti-angiogenesis", "protein", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Mobile", "phase", "A", "contained", "0.1", "%", "formic", "acid", "(", "v/v", ")", "in", "water", ";", "mobile", "phase", "B", "contained", "0.1", "%", "formic", "acid", "in", "80", "%", "acetonitrile", "(", "ACN", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Peptides", "were", "desalted", "by", "StageTips", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "As", "illustrated", "in", "Fig.", " ", "2", ",", "a", "significant", "increase", "(", "p", " ", "A.", "incana", "exerts", "cytostatic", "effects", "on", "HeLa", "cells", "by", "inducing", "cell", "cycle", "arrest", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "That", "being", "said", ",", "the", "release", "of", "P-TEFb", "from", "the", "7SK", "RNP", "complex", "has", "been", "shown", "to", "directly", "correlate", "with", "increased", "BRD4", "binding", ",", "suggesting", "that", "release", "from", "any", "one", "complex", "will", "not", "necessarily", "increase", "the", "amount", "of", "unbound", "P-TEFb", "or", "the", "amount", "recruited", "to", "specific", "sites", "of", "transcription", "[", "33", "]", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "p53", ",", "a", "critical", "tumor", "suppressor", ",", "enhances", "Bax", "expression", ",", "thus", "its", "stimulation", "tipping", "the", "balance", "towards", "apoptosis", "[", "22", "]", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "assays", "had", "been", "optimized", "for", "enough", "sensitivity", "to", "detect", "the", "reduced", "expression", "in", "Endostar", "treated", "A549", "cells", "and", "NCI-H1299", "cells", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "B-CellType", "O" ]
[ "Necrosis", "also", "increased", "by", "2.5-fold", "(", "2.84", "%", "vs.", "1.15", "%", "in", "the", "control", ")", ",", "indicating", "a", "broad", "cytotoxic", "effect", "on", "HeLa", "cells", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O" ]
[ "\n", "Source", "paper", ":", "PMC12141184" ]	[ "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Data", "analysis", "was", "performed", "using", "GraphPad", "Prism", "software", "(", "Version", "8.0", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "All", "software", "used", "in", "data", "analysis", "along", "with", "statistical", "parameters", "were", "mentioned", "in", "the", "appropriate", "Figure", " ", "legends", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "results", "3", "." ]	[ "O", "O", "O" ]
[ "At", "25", "and", "50", "μg/mL", ",", "the", "extract", "had", "an", "insignificant", "impact", "on", "the", "viability", "of", "HeLa", "cells", ",", "lacked", "apoptosis-inducing", "effects", ",", "and", "induced", "slight", "increases", "(", "≤5", "%", ")", "in", "the", "HeLa", "cell", "percentages", "in", "the", "S", ",", "G2/M", ",", "and", "sub-G1", "phases", "in", "comparison", "with", "the", "control", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Other", "polar", "conifer", "bark", "extracts", "exhibited", "higher", "activity", "on", "HeLa", "cells", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O" ]
[ "This", "is", "a", "crucial", "finding", "science", "cell", "cycle", "arrest", "at", "key", "checkpoints", "is", "a", "well-established", "therapeutic", "strategy", "for", "inhibiting", "cancer", "cell", "proliferation", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O" ]
[ "Only", "peptides", "with", "at", "least", "six", "amino", "acids", "in", "length", "were", "considered", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Given", "that", "STAT1", "has", "been", "implicated", "in", "both", "pro-apoptotic", "and", "pro-survival", "signaling", ",", "the", "net", "effect", "of", "its", "inhibition", "may", "depend", "on", "the", "cellular", "context", "and", "additional", "regulatory", "factors", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "this", "context", ",", "the", "aim", "of", "the", "“", "shock-and-kill", "”", "strategy", "is", "to", "reactivate", "latently", "infected", "cells", "with", "latency", "reversal", "agents", "(", "LRAs", ")", "and", "render", "them", "vulnerable", "to", "cell", "death", "or", "clearance", "by", "the", "immune", "system.7,8", "Previously", "reported", "approaches", "to", "HIV", "reactivation", ",", "including", "protein", "kinase", "C", "(", "PRKC", ")", "agonists", ",", "histone", "deacetylase", "(", "HDAC", ")", "inhibitors", "(", "HDACi", ")", ",", "and", "toll-like", "receptor", "(", "TLR", ")", "agonists,9", "have", "been", "highly", "effective", "in", "in", " ", "vitro", "models", "of", "latency", ",", "but", "their", "efficacy", "is", "only", "moderate", "when", "tested", "in", " ", "vivo.10,11,12,13", "Moreover", ",", "by", "broadly", "activating", "cellular", "pathways", ",", "these", "compounds", "elicit", "significant", "proinflammatory", "effects", "or", "alter", "the", "function", "and", "fate", "of", "specific", "immune", "effector", "cells,14,15", "hence", "limiting", "their", "use", "in", "clinical", "settings.16,17,18,19", "Similarly", ",", "promising", "candidates", "such", "as", "bryostatin-1", "and", "analogs", ",", "phorbol", "esters", ",", "and", "phosphatidylethanolamine", "binding", "protein", "1", "(", "PEBP1", ")", "agonists", "reactivate", "HIV", "via", "activation", "of", "the", "canonical", "nuclear", "factor", "kappa", "B", "(", "NFKB", ")", "pathway,13,20", "inadvertently", "leading", "to", "uncontrolled", "cytokine", "release", "and", "overt", "T", " ", "cell", "activation.21,22", "Consequently", ",", "there", "is", "a", "need", "to", "develop", "alternative", "approach(es", ")", "that", "can", "reactivate", "latent", "reservoirs", "and", "eliminate", "infected", "cells", "without", "triggering", "systemic", "activation", ",", "inflammation", ",", "or", "impairment", "of", "immune", "clearance", "mechanisms", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "MYT1L", "protein", "was", "undetectable", ",", "which", "may", "implicate", "the", "involvement", "of", "post-transcriptional", "regulation", ",", "such", "as", "miRNA(s", ")", ",", "in", "MYT1L", "expression", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Regarding", "the", "mechanism", "whereby", "PCYT2", "influences", "cancer", "development", ",", "a", "previous", "report", "showed", "that", "PCYT2", "downregulation-induced", "phosphoethanolamine", "(", "PEtn", ")", "accumulation", "correlated", "with", "tumor", "growth", "under", "nutrient", "starvation", ",", "thereby", "PCYT2", "overexpression", "reduced", "PEtn", "levels", "and", "tumor", "growth", "[", "18", "]", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Various", "conifer", "bark", "extracts", "are", "used", "nowadays", "in", "the", "nutraceutical", ",", "food", ",", "and", "pharmaceutical", "industries", "because", "of", "their", "health-promoting", "effects", "in", "numerous", "ailments", "and", "diseases", "[", "27,28,29", "]", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "When", "the", "retina", "is", "damaged", ",", "Müller", "glia", "can", "dedifferentiate", "into", "Müller", "glia-derived", "progenitor", "cells", "(", "MGPCs", ")", ",", "acquiring", "a", "progenitor-like", "phenotype", "and", "starting", "to", "proliferate", ",", "thus", "contributing", "to", "retinal", "repair", "[", "39,40", "]", "." ]	[ "O", "O", "B-Tissue", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Therefore", ",", "inhibition", "of", "HIF-1", "and", "improvement", "of", "MHC", "class", "I", "expression", "on", "cancer", "cells", "is", "important", "to", "induce", "effective", "responses", "of", "cell-mediated", "immunity", "against", "cancer", "such", "as", "lung", "cancer", "for", "immunotherapies", ",", "including", "PD-1/PD-L1", "inhibitor", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Tissue", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "However", ",", "given", "that", "both", "the", "SEC", "and", "Tat", "recruit", "P-TEFb", "to", "sites", "of", "nascent", "transcription", ",", "they", "share", "some", "functional", "redundancy", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "alignment", "results", "of", "sequencing", "with", "the", "HIV-1", "genome", "in", "three", "patients", "were", "displayed", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "conclusion", ",", "the", "results", "of", "the", "present", "in", "vitro", "study", "provide", "evidence", "that", "the", "responses", "of", "Mueller", "cells", "to", "activation", "of", "the", "RAAS", "by", "angiotensin", "II", "depend", "on", "the", "environment", ":", "A", "pro-inflammatory", "response", "is", "observed", "under", "hyperglycemic", "(", "plus", "hypoxic", ")", "conditions", ",", "whereas", "changes", "induced", "by", "hypoxia", "are", "not", "modulated", "by", "angiotensin", "II", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "DNA", "was", "eluted", "with", "freshly", "prepared", "elution", "solution", "(", "1", "%", "SDS", "and", "0.1", "M", "NaHCO3", ")", "and", "heated", "at", "65", "°", "C", "overnight", "to", "reverse-crosslink", "the", "samples", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Specifically", ",", "we", "selected", "three", "host", "genes", ",", "PRDM1", ",", "SLITRK5", ",", "and", "TGFB2", ",", "for", "further", "validation", "of", "our", "proposed", "PRMT3-TEAD4", "regulation", "model", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Understanding", "the", "dynamics", "of", "P-TEFb", "distribution", "and", "relocalization", "upon", "different", "types", "of", "perturbation", "is", "an", "ongoing", "area", "of", "investigation", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "However", ",", "in", "the", "present", ",", "we", "found", "that", "CDP-Etn", "supplementation", "inhibited", "HCC", "migration", ",", "invasion", "and", "proliferation", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "\n", "Source", "paper", ":", "PMC11641291" ]	[ "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Conclusion", "This", "study", "demonstrates", "that", "the", "A.", "incana", "DCM", "fraction", ",", "rich", "in", "bioactive", "compounds", "such", "as", "phytol", ",", "palmitic", "acid", ",", "and", "linolenic", "acid", ",", "exerts", "notable", "cytotoxic", "effects", "on", "various", "cancer", "cell", "lines", ",", "particularly", "HeLa", "cells", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O" ]
[ "\n", "Source", "paper", ":", "PMC10442740" ]	[ "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Clinical", "trials", "support", "the", "benefits", "of", "polydatin", "in", "chronic", "pelvic", "pain", ",", "liver", "diseases", ",", "inflammatory", "bowel", "syndrome", ",", "and", "EGFR-tyrosine", "kinase", "inhibitor", "(TKI)-related", "ashes", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Tissue", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Consequently", ",", "their", "antagonists", "are", "thought", "to", "either", "directly", "induce", "or", "sensitize", "cancerous", "cells", "to", "death", "by", "triggering", "proapoptotic", "pathways.50,51", "Interestingly", ",", "IAPs", "such", "as", "BIRC2", "have", "recently", "been", "shown", "to", "be", "negative", "regulators", "of", "HIV", "transcription", ",", "and", " ", "their", "expression", "is", "found", "to", "be", "correlated", "with", "viral", "latency.23,31,32", "Indeed", ",", "both", "BIRC2/3", "and", "XIAP", "are", "overexpressed", "in", "HIV", "latently", "infected", "CD4", "+", "T", "and", "myeloid", "cells", ",", "and", "the", "SMs", "which", "induce", "the", "degradation", "of", "these", "IAPs", "can", "reactivate", "HIV", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Despite", "this", ",", "both", "species", "showed", "their", "most", "potent", "cytotoxic", "effects", "against", "HeLa", "cells", ",", "suggesting", "a", "potential", "shared", "mechanism", "targeting", "cervical", "cancer", "cells", "specifically", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "O", "O" ]
[ "All", "efforts", "were", "made", "to", "have", "equal", "or", "comparable", "number", "of", "mice", "or", "samples", "(", "i.e.", ",", "number", "of", "n", ")", "per", "experimental", "group", "or", "condition", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "CYTOR", "also", "exerts", "its", "effects", "indirectly", "by", "controlling", "global", "gene", "expression", "along", "with", "actin", "dynamic", "pathways", ",", "thereby", "affecting", "T", "cell", "activation", "and", "HIV", "infection", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "While", "KL-2", "alone", "failed", "to", "significantly", "increase", "HIV-1", "gag", "transcript", "levels", "in", "patient", "PBMCs", ",", "in", "combination", "with", "AZD5582", "it", "resulted", "in", "a", "16-fold", "increase", "over", "AZD5582", "treatment", "alone", "and", "a", "53-fold", "increase", "over", "the", "DMSO", "control", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "ERK1/2", "signaling", "may", "be", "reactivated", "upon", "the", "development", "of", "drug", "resistance", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Pause", "release", "is", "regulated", "by", "positive", "transcription", "elongation", "factor-b", "(", "P-TEFb", ")", ",", "a", "heterodimeric", "protein", "complex", "composed", "of", "cyclin-dependent", "kinase", "9", "(", "CDK9", ")", "and", "cyclin", "T1", "(", "CCNT1", ")", "[", "19–21", "]", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Chromatin", "immunoprecipitation", "(", "chip", ")", "analysis", "Control", "cells", "expressing", "scramble", "shRNA", "or", "cells", "where", "CYTOR", "expression", "was", "depleted", "(", "KD", ")", "were", "cross-linked", "with", "1", "%", "formaldehyde", "for", "10", "minutes", "and", "then", "washed", "with", "PBS", "and", "reverse", "cross-linked", "with", "glycine", "(", "125mM", ";", "5", "minutes", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "It", "could", "be", "suggested", "that", "an", "incubation", "time", "of", "6", "h", "is", "too", "short", ",", "but", "due", "to", "the", "short", "half-life", "of", "angiotensin", "II", ",", "longer", "exposure", "times", "would", "likely", "not", "result", "in", "more", "relevant", "data", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "On", "cellular", "gene", "promoters", "such", "as", "the", "three", "genes", "mentioned", "above", ",", "it", "is", "conceivable", "that", "transcription", "can", "also", "be", "modulated", "through", "controlling", "the", "function", "and/or", "binding", "of", "the", "PRMT3-TEAD4", "complex", "to", "the", "GGAAT", "motif", "in", "response", "to", "changes", "in", "physiological", "or", "pathological", "conditions", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "upregulation", "of", "PD-L1", "in", "response", "to", "IFN-γ", "was", "confirmed", "at", "both", "the", "mRNA", "and", "protein", "levels", ",", "as", "demonstrated", "by", "qRT-PCR", "and", "Western", "blotting", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "level", "of", "p", " ", "*", "*", "*", "Results", "*", "*", "*", "Discussion", "The", "host", "immune", "system", "exerts", "immunosurveillance", "to", "control", "cancer", "development", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Tissue", "I-Tissue", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Glycosylated", "stilbene", "scaffolds", "have", "great", "potential", "for", "therapeutic", "applications", ",", "so", "further", "studies", "are", "needed", "to", "assess", "the", "bioactive", "potential", "of", "resveratroloside", "(", "1", ")", "and", "pinostilbenoside", "(", "2", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Notably", ",", "the", "biological", "complexity", "of", "tumor", "microenvironments", ",", "such", "as", "gene", "expression", "variability", ",", "signaling", "heterogeneity", ",", "immune", "interactions", ",", "and", "stromal", "influences", ",", "can", "not", "be", "adequately", "mimicked", "using", "isolated", "cell", "lines", "like", "HeLa", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "B-CellLine", "O" ]

[ "Then", ",", "we", "performed", "anti-Flag", "ChIP-qPCR", "in", "cells", "transfected", "with", "the", "sgLTRs-dCas9", "-", "3", " ", "×", " ", "Flag", "plasmids", "to", "further", "verify", "the", "abilities", "of", "the", "sgLTRs", "to", "target", "dCas9", "-", "3", " ", "×", " ", "Flag", "to", "the", "LTR", ",", "and", "found", "that", "sgLTR-1", "and", "-2", "failed", "to", "recruit", "dCas9", "to", "LTR", "efficiently", "(", "Supplementary", "Fig.", " ", "1a", ",", "b", ")", ",", "sgLTR-5", "and", "-6", "displayed", "the", "most", "significant", "effect", ",", "whereas", "sgLTR-3", ",", "-4", "and", "-7", "all", "displayed", "a", "similar", "and", "partial", "effect", "(", "Supplementary", "Fig.", " ", "1c", ",", "d", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Thus", ",", "the", "concentrations", "of", "the", "vasodilator", "angiotensin", "(", "1", "-", "7", ")", "formed", "by", "protease", "ACE2", "may", "be", "higher", ",", "and", "through", "its", "interaction", "with", "receptor", "MAS1", ",", "anti-angiogenic", "and", "anti-inflammatory", "processes", "can", "be", "induced", "(", "24", "-", "27", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "For", "comparison", "of", "RT-qPCR", "signals", "from", "treated", "cells", "to", "the", "hypothetical", "value", "of", "1", "(", "normalized", "to", "the", "signal", "of", "control", "cells", ")", ",", "a", "one-sample", "t-test", "was", "used", ",", "as", "in", "this", "type", "of", "statistical", "analysis", ",", "the", "variability", "of", "the", "values", "obtained", "from", "control", "cell", "signals", "is", "taken", "into", "consideration", ",", "although", "they", "appear", "without", "standard", "deviations", "(", "SD=0", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Bivalent", "SMs", "are", "more", "effective", "than", "their", "monovalent", "counterparts", ",", "probably", "because", "of", "the", "presence", "of", "dimers", "that", "may", "contribute", "to", "a", "more", "stable", "and", "enhanced", "activation", "via", "interactions", "with", "the", "two", "adjacent", "binding", "domains", "of", "IAPs.52", "Among", "the", "bivalent", "SMs", "we", "examined", ",", "APG-1387", "is", "most", "effective", "at", "degrading", "IAPs", ",", "facilitating", "a", "conversion", "of", "NFKB", "p100", "to", "p52", ",", "and", "reactivating", "HIV", "expression", "through", "an", "NIK-dependent", "process", ",", "a", "hallmark", "of", "an", "activated", "non-canonical", "NFKB", "pathway.23,24", "In", "CD4", "+", "T", " ", "cell", "models", "of", "HIV", "latency", ",", "APG-1387", "treatment", "is", "associated", "with", "remarkable", "viral", "reactivation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Recently", ",", "interest", "in", "the", "role", "of", "PCYT2", "in", "cancer", "has", "been", "growing", "[", "18,23,24", "]", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Given", "the", "documented", "cytotoxic", "activity", "of", "the", "DCM", "extract", "from", "the", "related", "subspecies", "A.", "rugosa", "[", "8", "]", ",", "we", "hypothesized", "that", "A.", "incana", "might", "exhibit", "similar", "effects", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "This", "effect", "has", "been", "supported", "by", "biochemical", "purifications", "of", "HIV-1", "Tat", "from", "human", "cell", "lines", "that", "revealed", "interactions", "with", "a", "larger", "SEC", "[", "41,42", "]", ",", "as", "well", "as", "by", "genetic", "knock-down", "experiments", "in", "cell", "lines", "showing", "a", "decrease", "in", "Tat-dependent", "transcription", "upon", "SEC", "component", "depletion", "[", "64,65", "]", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "IL-8", "is", "a", "well-characterized", "ELR+", "CXC", "chemokine", "that", "attracts", "neutrophils", "through", "binding", "CXCR1", "and", "CXCR2", "receptors", "on", "the", "cell", "surface", "[", "47", "]", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Rna", "sequencing", "analysis", "Sequencing", "data", "was", "demultiplexed", "and", "trimmed", "using", "Trimmomatic", "v0.36", "to", "remove", "adapters", "and", "low-quality", "reads", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Both", "display", "key", "steps", "of", "gene", "transcription", ",", "which", "include", "initiation", ",", "promoter", "arrest", ",", "and", "elongation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "this", "study", ",", "we", "found", "that", "in", "normal", "DNA-PK", "glioblastoma", "M059", "K", "cell", "lines", ",", "knockdown", "of", "MYT1L", "attenuated", "cell", "proliferation", "and", "induced", "apoptosis", "and", "S-phase", "cell", "cycle", "arrest", "(", "Figure", "1A", "–", "D", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Tissue", "B-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Thus", ",", "in", "addition", "to", "PRMT3", ",", "other", "members", "of", "the", "PRMT", "family", "should", "be", "explored", "as", "potential", "targets", "for", "developing", "effective", "antiviral", "drugs", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Further", "in-depth", "mechanistic", "studies", ",", "along", "with", "rigorous", "in", "vivo", "evaluations", "using", "clinically", "relevant", "models", "such", "as", "patient-derived", "xenografts", ",", "are", "essential", "to", "validate", "these", "promising", "findings", "and", "fully", "realize", "the", "clinical", "potential", "of", "this", "natural", "fraction", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "T-test", "was", "performed", "to", "determine", "the", "significant", "of", "differences", "between", "two", "groups", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "discussion", "Cell", "surface", "receptors", "and", "their", "coupled", "intracellular", "signaling", "pathways", "have", "been", "intensively", "studied", "in", "many", "physiological", "and", "pathological", "processes", "over", "five", "decades", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "A", "trend", "toward", "a", "decrease", "was", "also", "observed", "in", "response", "to", "sustained", "high-glucose", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Results", "Discussion", "In", "this", "study", ",", "we", "demonstrate", "a", "potential", "new", "strategy", "for", "enhancing", "HIV-1", "latency", "reversal", "through", "the", "release", "of", "P-TEFb", "from", "the", "cellular", "pool", "of", "SECs", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "are", "aware", "that", "the", "model", "of", "stimulated", "CD4", "+", "primary", "cells", "does", "not", "recapitulate", "the", "actual", "state", "of", "the", "reservoir", ",", "which", "is", "mainly", "comprise", "of", "resting", "CD4", "+", "T", "cells", "that", "do", "not", "support", "HIV", "infection", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Here", ",", "we", "discovered", "that", "MYT1L", "could", "directly", "regulate", "the", "transcription", "of", "CXCR1", "through", "a", "novel", "cis-acting", "element", "(", "−2114/−2103", ")", "at", "the", "CXCR1", "promoter", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "DNA-PK", "inhibited", "the", "transcription", "of", "the", "xanthine", "oxidoreductase", "gene", "via", "E-box/TATA-like", "elements", "[", "44", "]", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Cisplatin", "exerts", "its", "cytotoxic", "effects", "primarily", "through", "DNA", "cross-linking", ",", "causing", "extensive", "DNA", "damage", "that", "leads", "predominantly", "to", "G2/M", "cell", "cycle", "arrest", "and", "subsequent", "apoptosis", "induction", "mainly", "via", "p53-dependent", "pathways", "[", "24", ",", "25", "]", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Antigens", "must", "be", "processed", "into", "antigenic", "peptides", "by", "APM", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "statistical", "analysis", "The", "Student", "’s", "t-test", "was", "used", "to", "determine", "the", "statistical", "significance", "of", "differences", "in", "GROα", "expression", ",", "IL-8", "expression", ",", "cell", "growth", ",", "apoptosis", ",", "cell", "cycle", ",", "and", "luciferase", "activity", "between", "groups", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Although", "one", "of", "the", "most", "well-defined", "functions", "of", "DNA-PK", "is", "to", "govern", "the", "repair", "of", "DNA", "double-strand", "breaks", "through", "both", "non-homologous", "end-joining", "(", "NHEJ", ")", "and", "homologous", "recombination", "(", "HR", ")", "[", "42", "]", ",", "it", "was", "originally", "identified", "as", "a", "component", "of", "the", "Sp1", "transcription", "complex", "in", "which", "it", "may", "modulate", "the", "transcriptional", "activity", "of", "the", "complex", "by", "phosphorylating", "Sp1", "[", "43", "]", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "addition", ",", "the", "effects", "of", "other", "stressors", ",", "such", "as", "oxidative", "stress", "or", "hypoxia", ",", "which", "also", "play", "a", "role", "in", "diabetic", "retinal", "damage", ",", "were", "not", "included", "in", "our", "model", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "P-TEFb", "phosphorylates", "the", "C-terminal", "tail", "of", "RNA", "Pol", "II", "and", "several", "negative", "elongation", "factors", ",", "which", "collectively", "license", "transcriptional", "elongation", "[", "22–24", "]", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "blots", "were", "stripped", "before", "reprobing", "with", "an", "antibody", "against", "actin", "(", "Abcam", ",", "Cambridge", ",", "GH", ",", "UK", ")", "or", "GAPDH", "(", "Santa", "Cruz", "Biotechnology", ",", "Dallas", ",", "TX", ",", "USA", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Cells", "were", "then", "lysed", "for", "10", "minutes", "on", "ice", "in", "130μl", "sonication", "buffer", "(", "20", "mM", "Tris", "pH-7.8", ",", "2", "mM", "EDTA", ",", "0,5", "%", "SDS", ",", "0.5", "mM", "phenylmethylsulfonyl", "fluoride", "(", "PMSF", ")", ",", "and", "1", "%", "protease", "inhibitor", "cocktail", ")", ",", "and", "the", "nuclear", "pellets", "were", "collected", "." ]

[ "B-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "saponifiable", "fraction", "presented", "a", "balanced", "composition", "of", "saturated", "(", "48.69", "%", ")", "and", "unsaturated", "(", "51.29", "%", ")", "fatty", "acids", ",", "with", "palmitic", "acid", ",", "linolenic", "acid", ",", "and", "linoleic", "acid", "as", "the", "predominant", "compounds", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Besides", ",", "it", "was", "shown", "in", "this", "study", "that", "Endostar", "inhibited", "HIF-1", "with", "upregulation", "of", "MHC", "class", "I", "expression", "in", "A549", "and", "NCI-H1299", "lung", "cancer", "cells", ",", "benefiting", "cancer", "cell", "killing", "by", "effectory", "lymphocytes", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "B-CellType", "O", "O", "O", "B-CellType", "O" ]

[ "In", "contrast", ",", "HG", "MIO-M1", "cells", "maintain", "a", "basal", "high", "level", "of", "both", "GFAP", "and", "Vimentin", "together", "to", "less", "organized", "intermediate", "filaments", "across", "the", "different", "glucose", "treatments", ",", "suggesting", "a", "limited", "and", "static", "response", "to", "sustained", "high-glucose", "and", "GF", "treatments", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Tissue", "I-Tissue", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Therefore", ",", "a", "better", "understanding", "of", "the", "key", "players", "in", "the", "signaling", "pathways", "may", "offer", "opportunities", "for", "therapeutic", "intervention", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Research", "on", "the", "antitumor", "potential", "(", "mechanisms", "underlying", "cytotoxic", "activity", "in", "HeLa", "cells", ",", "cytotoxicity", "against", "other", "tumor", "cell", "lines", ")", "should", "also", "continue", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "enforced", "expression", "of", "MYT1L", "caused", "an", "elevation", "of", "GROα", "in", "HEK293", "and", "M059J", "cells", "(", "Figure", "4B", "–", "E", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "study", "employed", "the", "MIO-M1", "cell", "line", ",", "which", ",", "although", "well", "established", "in", "human", "retinal", "research", ",", "may", "not", "fully", "capture", "the", "physiological", "complexity", "of", "Müller", "cells", "found", "in", "human", "retina", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "B-Tissue", "O" ]

[ "F-actin", "was", "visualized", "with", "tetramethyl", "rhodamine", "isothiocyanate", "(TRITC)-conjugated", "phalloidin", "(", "1:1,000", ",", "1", "hour", ",", "room", "temperature", ";", "Sigma", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "However", ",", "in", "mammals", ",", "the", "SHH", "pathway", "alone", "may", "not", "be", "sufficient", "to", "overcome", "the", "intrinsic", "limitations", "of", "Müller", "cells", "to", "regenerate", "neuronal", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O" ]

[ "This", "failure", "is", "partly", "due", "to", "the", "latent", "reservoir", "’s", "heterogenous", "nature", ",", "such", "that", "treatment", "by", "a", "single", "agent", "that", "acts", "to", "target", "a", "specific", "block", "may", "only", "ever", "reactivate", "a", "small", "fraction", "of", "proviruses", "in", "vivo", "[", "10", "]", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "These", "may", "open", "new", "ways", "for", "developing", "novel", "therapeutic", "tools", "that", "will", "be", "integrated", "or", "substitute", "current", "strategies", "to", "successfully", "eliminate", "the", "HIV", "reservoir", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "SOCS1", "is", "known", "to", "act", "as", "a", "feedback", "inhibitor", "of", "JAK-STAT", "signaling", "(", "Liau", "et", "al.", "2018", ")", ",", "but", "paradoxically", ",", "its", "overexpression", "in", "tumors", "has", "been", "associated", "with", "immune", "escape", "mechanisms", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "These", "observations", "underscore", "the", "notion", "that", "glial", "cells", ",", "including", "Müller", "cells", "and", "astrocytes", ",", "exhibit", "differential", "SHH", "responses", "depending", "on", "the", "extent", "of", "glucose", "stress", ",", "highlighting", "the", "dynamic", "regulation", "of", "SHH", "signaling", "in", "glial", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "B-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O" ]

[ "To", "assess", "a", "possible", "pro-inflammatory", "response", "of", "Mueller", "cells", ",", "the", "changes", "in", "the", "expression", "of", "mRNA", "as", "well", "as", "secretion", "of", "the", "pro-inflammatory", "cytokine", "IL-6", ",", "which", "is", "constitutively", "expressed", "by", "this", "cell", "type", "(", "including", "MIO-M1", "cells", ")", ",", "was", "assessed", "(", "31", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "bark", "[", "45", "]", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Our", "findings", "have", "demonstrated", "a", "positive", "feedback", "DNA-PK/MYT1L-CXCR1-ERK1/2", "proliferative", "signaling", "loop", "in", "glioblastoma", "cells", "and", "might", "have", "significant", "therapeutic", "implications", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Therefore", ",", "Endostar", "has", "anti-angiogenesis", "effects", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Epigenetic", "constraints", "that", "suppress", "proviral", "gene", "transcription", "are", "essential", "for", "establishing", "HIV", "latency", "[", "16,17", "]", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "P#x003C;0.05", "was", "considered", "to", "indicate", "a", "statistically", "significant", "difference", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Multifaceted", "and", "heterogenous", "blocks", "to", "viral", "gene", "expression", "establish", "and", "maintain", "HIV-1", "latency", "at", "the", "epigenetic", ",", "transcriptional", ",", "and", "post-transcriptional", "levels", "[", "2", "]", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "antioxidant", "potential", "of", "the", "raw", "bark", "extract", "is", "strongly", "associated", "with", "the", "total", "phenolic", "content", ",", "quantified", "as", "299.3", "±", "1.4", "mg/g", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "results", "are", "consistent", "with", "previous", "studies", "on", "the", "antitumor", "potential", "of", "stilbenes", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "MHC", "class", "I", "molecules", "are", "glycoproteins", "of", "heterodimers", "with", "a", "polymorphic", "heavy", "chain", "(", "α-chain", ")", "and", "an", "invariable", "β2", "microglobulin", "(", "β2", " ", "m", ")", "light", "chain", "(", "β-chain", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Immunofluorescence", "analysis", "confirmed", "that", "IFN-γ", "treatment", "led", "to", "a", "marked", "accumulation", "of", "p-STAT1", "in", "the", "nucleus", ",", "reinforcing", "the", "notion", "that", "STAT1", "plays", "a", "crucial", "role", "in", "IFN-γ-mediated", "transcriptional", "regulation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Endostar", ",", "an", "N-terminal", "modified", "recombinant", "human", "endostatin", ",", "is", "a", "human", "recombinant", "endostatin", ",", "an", "attractive", "anti-angiogenesis", "protein", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Mobile", "phase", "A", "contained", "0.1", "%", "formic", "acid", "(", "v/v", ")", "in", "water", ";", "mobile", "phase", "B", "contained", "0.1", "%", "formic", "acid", "in", "80", "%", "acetonitrile", "(", "ACN", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Peptides", "were", "desalted", "by", "StageTips", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "As", "illustrated", "in", "Fig.", " ", "2", ",", "a", "significant", "increase", "(", "p", " ", "A.", "incana", "exerts", "cytostatic", "effects", "on", "HeLa", "cells", "by", "inducing", "cell", "cycle", "arrest", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "That", "being", "said", ",", "the", "release", "of", "P-TEFb", "from", "the", "7SK", "RNP", "complex", "has", "been", "shown", "to", "directly", "correlate", "with", "increased", "BRD4", "binding", ",", "suggesting", "that", "release", "from", "any", "one", "complex", "will", "not", "necessarily", "increase", "the", "amount", "of", "unbound", "P-TEFb", "or", "the", "amount", "recruited", "to", "specific", "sites", "of", "transcription", "[", "33", "]", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "p53", ",", "a", "critical", "tumor", "suppressor", ",", "enhances", "Bax", "expression", ",", "thus", "its", "stimulation", "tipping", "the", "balance", "towards", "apoptosis", "[", "22", "]", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "assays", "had", "been", "optimized", "for", "enough", "sensitivity", "to", "detect", "the", "reduced", "expression", "in", "Endostar", "treated", "A549", "cells", "and", "NCI-H1299", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "B-CellType", "O" ]

[ "Necrosis", "also", "increased", "by", "2.5-fold", "(", "2.84", "%", "vs.", "1.15", "%", "in", "the", "control", ")", ",", "indicating", "a", "broad", "cytotoxic", "effect", "on", "HeLa", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O" ]

[ "\n", "Source", "paper", ":", "PMC12141184" ]

[ "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Data", "analysis", "was", "performed", "using", "GraphPad", "Prism", "software", "(", "Version", "8.0", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "All", "software", "used", "in", "data", "analysis", "along", "with", "statistical", "parameters", "were", "mentioned", "in", "the", "appropriate", "Figure", " ", "legends", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "results", "3", "." ]

[ "O", "O", "O" ]

[ "At", "25", "and", "50", "μg/mL", ",", "the", "extract", "had", "an", "insignificant", "impact", "on", "the", "viability", "of", "HeLa", "cells", ",", "lacked", "apoptosis-inducing", "effects", ",", "and", "induced", "slight", "increases", "(", "≤5", "%", ")", "in", "the", "HeLa", "cell", "percentages", "in", "the", "S", ",", "G2/M", ",", "and", "sub-G1", "phases", "in", "comparison", "with", "the", "control", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Other", "polar", "conifer", "bark", "extracts", "exhibited", "higher", "activity", "on", "HeLa", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O" ]

[ "This", "is", "a", "crucial", "finding", "science", "cell", "cycle", "arrest", "at", "key", "checkpoints", "is", "a", "well-established", "therapeutic", "strategy", "for", "inhibiting", "cancer", "cell", "proliferation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O" ]

[ "Only", "peptides", "with", "at", "least", "six", "amino", "acids", "in", "length", "were", "considered", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Given", "that", "STAT1", "has", "been", "implicated", "in", "both", "pro-apoptotic", "and", "pro-survival", "signaling", ",", "the", "net", "effect", "of", "its", "inhibition", "may", "depend", "on", "the", "cellular", "context", "and", "additional", "regulatory", "factors", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "this", "context", ",", "the", "aim", "of", "the", "“", "shock-and-kill", "”", "strategy", "is", "to", "reactivate", "latently", "infected", "cells", "with", "latency", "reversal", "agents", "(", "LRAs", ")", "and", "render", "them", "vulnerable", "to", "cell", "death", "or", "clearance", "by", "the", "immune", "system.7,8", "Previously", "reported", "approaches", "to", "HIV", "reactivation", ",", "including", "protein", "kinase", "C", "(", "PRKC", ")", "agonists", ",", "histone", "deacetylase", "(", "HDAC", ")", "inhibitors", "(", "HDACi", ")", ",", "and", "toll-like", "receptor", "(", "TLR", ")", "agonists,9", "have", "been", "highly", "effective", "in", "in", " ", "vitro", "models", "of", "latency", ",", "but", "their", "efficacy", "is", "only", "moderate", "when", "tested", "in", " ", "vivo.10,11,12,13", "Moreover", ",", "by", "broadly", "activating", "cellular", "pathways", ",", "these", "compounds", "elicit", "significant", "proinflammatory", "effects", "or", "alter", "the", "function", "and", "fate", "of", "specific", "immune", "effector", "cells,14,15", "hence", "limiting", "their", "use", "in", "clinical", "settings.16,17,18,19", "Similarly", ",", "promising", "candidates", "such", "as", "bryostatin-1", "and", "analogs", ",", "phorbol", "esters", ",", "and", "phosphatidylethanolamine", "binding", "protein", "1", "(", "PEBP1", ")", "agonists", "reactivate", "HIV", "via", "activation", "of", "the", "canonical", "nuclear", "factor", "kappa", "B", "(", "NFKB", ")", "pathway,13,20", "inadvertently", "leading", "to", "uncontrolled", "cytokine", "release", "and", "overt", "T", " ", "cell", "activation.21,22", "Consequently", ",", "there", "is", "a", "need", "to", "develop", "alternative", "approach(es", ")", "that", "can", "reactivate", "latent", "reservoirs", "and", "eliminate", "infected", "cells", "without", "triggering", "systemic", "activation", ",", "inflammation", ",", "or", "impairment", "of", "immune", "clearance", "mechanisms", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "MYT1L", "protein", "was", "undetectable", ",", "which", "may", "implicate", "the", "involvement", "of", "post-transcriptional", "regulation", ",", "such", "as", "miRNA(s", ")", ",", "in", "MYT1L", "expression", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Regarding", "the", "mechanism", "whereby", "PCYT2", "influences", "cancer", "development", ",", "a", "previous", "report", "showed", "that", "PCYT2", "downregulation-induced", "phosphoethanolamine", "(", "PEtn", ")", "accumulation", "correlated", "with", "tumor", "growth", "under", "nutrient", "starvation", ",", "thereby", "PCYT2", "overexpression", "reduced", "PEtn", "levels", "and", "tumor", "growth", "[", "18", "]", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Various", "conifer", "bark", "extracts", "are", "used", "nowadays", "in", "the", "nutraceutical", ",", "food", ",", "and", "pharmaceutical", "industries", "because", "of", "their", "health-promoting", "effects", "in", "numerous", "ailments", "and", "diseases", "[", "27,28,29", "]", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "When", "the", "retina", "is", "damaged", ",", "Müller", "glia", "can", "dedifferentiate", "into", "Müller", "glia-derived", "progenitor", "cells", "(", "MGPCs", ")", ",", "acquiring", "a", "progenitor-like", "phenotype", "and", "starting", "to", "proliferate", ",", "thus", "contributing", "to", "retinal", "repair", "[", "39,40", "]", "." ]

[ "O", "O", "B-Tissue", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Therefore", ",", "inhibition", "of", "HIF-1", "and", "improvement", "of", "MHC", "class", "I", "expression", "on", "cancer", "cells", "is", "important", "to", "induce", "effective", "responses", "of", "cell-mediated", "immunity", "against", "cancer", "such", "as", "lung", "cancer", "for", "immunotherapies", ",", "including", "PD-1/PD-L1", "inhibitor", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Tissue", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "However", ",", "given", "that", "both", "the", "SEC", "and", "Tat", "recruit", "P-TEFb", "to", "sites", "of", "nascent", "transcription", ",", "they", "share", "some", "functional", "redundancy", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "alignment", "results", "of", "sequencing", "with", "the", "HIV-1", "genome", "in", "three", "patients", "were", "displayed", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "conclusion", ",", "the", "results", "of", "the", "present", "in", "vitro", "study", "provide", "evidence", "that", "the", "responses", "of", "Mueller", "cells", "to", "activation", "of", "the", "RAAS", "by", "angiotensin", "II", "depend", "on", "the", "environment", ":", "A", "pro-inflammatory", "response", "is", "observed", "under", "hyperglycemic", "(", "plus", "hypoxic", ")", "conditions", ",", "whereas", "changes", "induced", "by", "hypoxia", "are", "not", "modulated", "by", "angiotensin", "II", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "DNA", "was", "eluted", "with", "freshly", "prepared", "elution", "solution", "(", "1", "%", "SDS", "and", "0.1", "M", "NaHCO3", ")", "and", "heated", "at", "65", "°", "C", "overnight", "to", "reverse-crosslink", "the", "samples", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Specifically", ",", "we", "selected", "three", "host", "genes", ",", "PRDM1", ",", "SLITRK5", ",", "and", "TGFB2", ",", "for", "further", "validation", "of", "our", "proposed", "PRMT3-TEAD4", "regulation", "model", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Understanding", "the", "dynamics", "of", "P-TEFb", "distribution", "and", "relocalization", "upon", "different", "types", "of", "perturbation", "is", "an", "ongoing", "area", "of", "investigation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "However", ",", "in", "the", "present", ",", "we", "found", "that", "CDP-Etn", "supplementation", "inhibited", "HCC", "migration", ",", "invasion", "and", "proliferation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "\n", "Source", "paper", ":", "PMC11641291" ]

[ "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Conclusion", "This", "study", "demonstrates", "that", "the", "A.", "incana", "DCM", "fraction", ",", "rich", "in", "bioactive", "compounds", "such", "as", "phytol", ",", "palmitic", "acid", ",", "and", "linolenic", "acid", ",", "exerts", "notable", "cytotoxic", "effects", "on", "various", "cancer", "cell", "lines", ",", "particularly", "HeLa", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O" ]

[ "\n", "Source", "paper", ":", "PMC10442740" ]

[ "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Clinical", "trials", "support", "the", "benefits", "of", "polydatin", "in", "chronic", "pelvic", "pain", ",", "liver", "diseases", ",", "inflammatory", "bowel", "syndrome", ",", "and", "EGFR-tyrosine", "kinase", "inhibitor", "(TKI)-related", "ashes", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Tissue", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Consequently", ",", "their", "antagonists", "are", "thought", "to", "either", "directly", "induce", "or", "sensitize", "cancerous", "cells", "to", "death", "by", "triggering", "proapoptotic", "pathways.50,51", "Interestingly", ",", "IAPs", "such", "as", "BIRC2", "have", "recently", "been", "shown", "to", "be", "negative", "regulators", "of", "HIV", "transcription", ",", "and", " ", "their", "expression", "is", "found", "to", "be", "correlated", "with", "viral", "latency.23,31,32", "Indeed", ",", "both", "BIRC2/3", "and", "XIAP", "are", "overexpressed", "in", "HIV", "latently", "infected", "CD4", "+", "T", "and", "myeloid", "cells", ",", "and", "the", "SMs", "which", "induce", "the", "degradation", "of", "these", "IAPs", "can", "reactivate", "HIV", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Despite", "this", ",", "both", "species", "showed", "their", "most", "potent", "cytotoxic", "effects", "against", "HeLa", "cells", ",", "suggesting", "a", "potential", "shared", "mechanism", "targeting", "cervical", "cancer", "cells", "specifically", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "O", "O" ]

[ "All", "efforts", "were", "made", "to", "have", "equal", "or", "comparable", "number", "of", "mice", "or", "samples", "(", "i.e.", ",", "number", "of", "n", ")", "per", "experimental", "group", "or", "condition", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "CYTOR", "also", "exerts", "its", "effects", "indirectly", "by", "controlling", "global", "gene", "expression", "along", "with", "actin", "dynamic", "pathways", ",", "thereby", "affecting", "T", "cell", "activation", "and", "HIV", "infection", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "While", "KL-2", "alone", "failed", "to", "significantly", "increase", "HIV-1", "gag", "transcript", "levels", "in", "patient", "PBMCs", ",", "in", "combination", "with", "AZD5582", "it", "resulted", "in", "a", "16-fold", "increase", "over", "AZD5582", "treatment", "alone", "and", "a", "53-fold", "increase", "over", "the", "DMSO", "control", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "ERK1/2", "signaling", "may", "be", "reactivated", "upon", "the", "development", "of", "drug", "resistance", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Pause", "release", "is", "regulated", "by", "positive", "transcription", "elongation", "factor-b", "(", "P-TEFb", ")", ",", "a", "heterodimeric", "protein", "complex", "composed", "of", "cyclin-dependent", "kinase", "9", "(", "CDK9", ")", "and", "cyclin", "T1", "(", "CCNT1", ")", "[", "19–21", "]", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Chromatin", "immunoprecipitation", "(", "chip", ")", "analysis", "Control", "cells", "expressing", "scramble", "shRNA", "or", "cells", "where", "CYTOR", "expression", "was", "depleted", "(", "KD", ")", "were", "cross-linked", "with", "1", "%", "formaldehyde", "for", "10", "minutes", "and", "then", "washed", "with", "PBS", "and", "reverse", "cross-linked", "with", "glycine", "(", "125mM", ";", "5", "minutes", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]