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stringlengths 19
61
| input
stringlengths 7
34
| output
stringlengths 132
823
| sample_id
stringlengths 1
28
| question_type
stringclasses 4
values | difficulty
stringclasses 3
values | species_involved
listlengths 0
3
|
|---|---|---|---|---|---|---|
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: eJXEY04B001
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：3.416
多样性良好，菌群结构相对平衡
- Simpson指数：0.941
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：318种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 急性感染状态
|
eJXEY04B001
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
请分析样本 7709 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 7709
|
根据样本 7709 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：1,567,034
- 检出物种数：138
- Shannon多样性指数：3.062
- Simpson多样性指数：0.912
**二、优势菌群**
- Bacteroides thetaiotaomicron (18.0%)
- Mus musculus (14.1%)
- Akkermansia muciniphila (10.1%)
- Lactococcus lactis (10.0%)
- Lactococcus intestinalis (8.5%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性良好，微生态状态相对健康。
|
7709
|
overview
|
basic
|
[
"Bacteroides thetaiotaomicron (18.0%)",
"Mus musculus (14.1%)",
"Akkermansia muciniphila (10.1%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 7722
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：3.568
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.948
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：237种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
7722
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 1940
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Prevotella copri (39.7%)
- Prevotella stercorea (9.2%)
- Prevotella hominis (5.7%)
- Megamonas funiformis (2.6%)
- Faecalibacterium prausnitzii (2.0%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为3.214，表明菌群多样性良好
- 物种丰富度：308个物种
**关键发现：**
- 菌群多样性良好，微生态平衡
- 优势菌为常驻菌群（Prevotella属），总体正常
|
1940
|
overview
|
basic
|
[
"Prevotella copri (39.7%)",
"Prevotella stercorea (9.2%)",
"Prevotella hominis (5.7%)"
] |
检测到 Fusobacterium nucleatum，丰度为 0.51%，请评估其临床意义。
|
样本ID: ZYZJ02-A006
|
Fusobacterium nucleatum（具核梭杆菌）检测分析：
**1. 病原体特征**
- 检出丰度：0.51%
- 读数：415,435
- 致病类别：oral
- 临床风险等级：medium
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低（<1%），可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状，仍需警惕；若无症状，可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 结合临床症状评估
2. 必要时进行药敏试验
3. 动态监测菌量变化
|
ZYZJ02-A006
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Fusobacterium nucleatum"
] |
检测到 Streptococcus pneumoniae，丰度为 0.48%，请评估其临床意义。
|
样本ID: JXEY06A017
|
Streptococcus pneumoniae（肺炎链球菌）检测分析：
**1. 病原体特征**
- 检出丰度：0.48%
- 读数：296,137
- 致病类别：respiratory
- 临床风险等级：high
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低（<1%），可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状，仍需警惕；若无症状，可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 进行药敏试验指导用药
2. 根据感染部位选择合适抗菌方案
3. 密切监测治疗效果
|
JXEY06A017
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Streptococcus pneumoniae"
] |
请分析样本 JXEY05A027 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: JXEY05A027
|
根据样本 JXEY05A027 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：51,436,608
- 检出物种数：1477
- Shannon多样性指数：5.05
- Simpson多样性指数：0.985
**二、优势菌群**
- Streptococcus mitis (6.1%)
- Streptococcus oralis (5.1%)
- Gemella haemolysans (3.5%)
- Capnocytophaga leadbetteri (3.2%)
- Gemella sanguinis (2.2%)
**三、检出病原体情况**
检出 14 种潜在病原体：
- Streptococcus pneumoniae
- Fusobacterium nucleatum
- Neisseria meningitidis
- Campylobacter concisus
- Haemophilus influenzae
- Moraxella catarrhalis
- Staphylococcus aureus
- Aggregatibacter actinomycetemcomitans
- Porphyromonas gingivalis
- Enterococcus faecium
- Tannerella forsythia
- Treponema denticola
- Cutibacterium acnes
- Legionella pneumophila
**四、总体评估**
菌群多样性良好，微生态状态相对健康。
|
JXEY05A027
|
overview
|
basic
|
[
"Streptococcus mitis (6.1%)",
"Streptococcus oralis (5.1%)",
"Gemella haemolysans (3.5%)"
] |
检测到 Acinetobacter baumannii，丰度为 0.00%，请评估其临床意义。
|
样本ID: PTH20250114-1
|
Acinetobacter baumannii（鲍曼不动杆菌）检测分析：
**1. 病原体特征**
- 检出丰度：0.00%
- 读数：57
- 致病类别：respiratory
- 临床风险等级：high
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低（<1%），可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状，仍需警惕；若无症状，可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 进行药敏试验指导用药
2. 根据感染部位选择合适抗菌方案
3. 密切监测治疗效果
|
PTH20250114-1
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Acinetobacter baumannii"
] |
针对此微生物检测结果，应该采取什么治疗策略？
|
样本ID: JXEY07A005
|
治疗策略建议：
**一、主要关注病原体**
- Streptococcus pneumoniae（肺炎链球菌）- 风险等级：high
- Campylobacter concisus（简明弯曲杆菌）- 风险等级：low
- Haemophilus influenzae（流感嗜血杆菌）- 风险等级：medium
**二、经验性抗菌治疗建议**
- 以革兰阳性菌为主，首选：万古霉素或利奈唑胺（疑似MRSA时）
- 非耐药菌可选：苯唑西林或头孢唑林
**三、进一步检查建议**
- 药敏试验指导精准用药
- 炎症指标监测（CRP、PCT）
- 必要时重复微生物检测评估疗效
**四、治疗监测要点**
- 48-72小时评估临床反应
- 根据药敏结果降阶梯治疗
- 注意药物不良反应监测
**注意：** 治疗方案需结合患者临床症状、既往用药史及当地耐药流行病学数据综合制定。
|
JXEY07A005
|
clinical
|
advanced
|
[
"Streptococcus pneumoniae",
"Campylobacter concisus",
"Haemophilus influenzae"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 5996
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：5.637
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.994
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：551种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
5996
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
针对此微生物检测结果，应该采取什么治疗策略？
|
样本ID: JXEY01D008
|
治疗策略建议：
**一、主要关注病原体**
- Fusobacterium nucleatum（具核梭杆菌）- 风险等级：medium
- Streptococcus pneumoniae（肺炎链球菌）- 风险等级：high
- Prevotella intermedia（中间普雷沃菌）- 风险等级：low
**二、经验性抗菌治疗建议**
- 以革兰阳性菌为主，首选：万古霉素或利奈唑胺（疑似MRSA时）
- 非耐药菌可选：苯唑西林或头孢唑林
**三、进一步检查建议**
- 药敏试验指导精准用药
- 炎症指标监测（CRP、PCT）
- 必要时重复微生物检测评估疗效
**四、治疗监测要点**
- 48-72小时评估临床反应
- 根据药敏结果降阶梯治疗
- 注意药物不良反应监测
**注意：** 治疗方案需结合患者临床症状、既往用药史及当地耐药流行病学数据综合制定。
|
JXEY01D008
|
clinical
|
advanced
|
[
"Fusobacterium nucleatum",
"Streptococcus pneumoniae",
"Prevotella intermedia"
] |
请分析样本 7525 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 7525
|
根据样本 7525 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：3,661,072
- 检出物种数：29
- Shannon多样性指数：2.202
- Simpson多样性指数：0.845
**二、优势菌群**
- Anas platyrhynchos (32.5%)
- Mesorhizobium silamurunense (11.2%)
- Cobetia crustatorum (9.6%)
- Elizabethkingia argenteiflava (9.3%)
- Anser cygnoides (8.3%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性处于正常范围，建议定期监测。
|
7525
|
overview
|
basic
|
[
"Anas platyrhynchos (32.5%)",
"Mesorhizobium silamurunense (11.2%)",
"Cobetia crustatorum (9.6%)"
] |
检测到 Neisseria meningitidis，丰度为 0.15%，请评估其临床意义。
|
样本ID: JXEY06C003
|
Neisseria meningitidis（脑膜炎奈瑟菌）检测分析：
**1. 病原体特征**
- 检出丰度：0.15%
- 读数：85,744
- 致病类别：systemic
- 临床风险等级：critical
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低（<1%），可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状，仍需警惕；若无症状，可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 立即进行确认检测
2. 启动感染控制措施
3. 进行药敏试验
4. 考虑会诊感染科
|
JXEY06C003
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Neisseria meningitidis"
] |
检测到 Fusobacterium nucleatum，丰度为 0.23%，请评估其临床意义。
|
样本ID: JXEY06D017
|
Fusobacterium nucleatum（具核梭杆菌）检测分析：
**1. 病原体特征**
- 检出丰度：0.23%
- 读数：136,873
- 致病类别：oral
- 临床风险等级：medium
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低（<1%），可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状，仍需警惕；若无症状，可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 结合临床症状评估
2. 必要时进行药敏试验
3. 动态监测菌量变化
|
JXEY06D017
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Fusobacterium nucleatum"
] |
针对此微生物检测结果，应该采取什么治疗策略？
|
样本ID: JXEY07C008
|
治疗策略建议：
**一、主要关注病原体**
- Streptococcus pneumoniae（肺炎链球菌）- 风险等级：high
- Fusobacterium nucleatum（具核梭杆菌）- 风险等级：medium
- Neisseria meningitidis（脑膜炎奈瑟菌）- 风险等级：critical
**二、经验性抗菌治疗建议**
- 以革兰阳性菌为主，首选：万古霉素或利奈唑胺（疑似MRSA时）
- 非耐药菌可选：苯唑西林或头孢唑林
**三、进一步检查建议**
- 药敏试验指导精准用药
- 炎症指标监测（CRP、PCT）
- 必要时重复微生物检测评估疗效
**四、治疗监测要点**
- 48-72小时评估临床反应
- 根据药敏结果降阶梯治疗
- 注意药物不良反应监测
**注意：** 治疗方案需结合患者临床症状、既往用药史及当地耐药流行病学数据综合制定。
|
JXEY07C008
|
clinical
|
advanced
|
[
"Streptococcus pneumoniae",
"Fusobacterium nucleatum",
"Neisseria meningitidis"
] |
检测到 Neisseria meningitidis，丰度为 0.10%，请评估其临床意义。
|
样本ID: JXEY02C046
|
Neisseria meningitidis（脑膜炎奈瑟菌）检测分析：
**1. 病原体特征**
- 检出丰度：0.10%
- 读数：89,736
- 致病类别：systemic
- 临床风险等级：critical
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低（<1%），可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状，仍需警惕；若无症状，可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 立即进行确认检测
2. 启动感染控制措施
3. 进行药敏试验
4. 考虑会诊感染科
|
JXEY02C046
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Neisseria meningitidis"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 7539
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：4.267
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.922
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：1993种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
7539
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: JXEY03D047
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：3.022
多样性良好，菌群结构相对平衡
- Simpson指数：0.862
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：751种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 急性感染状态
|
JXEY03D047
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 2250
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：3.777
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.949
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：365种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
2250
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 5507
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：6.838
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.998
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：2040种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
5507
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: ZYZJ06-A023
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：4.121
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.964
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：925种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 急性感染状态
|
ZYZJ06-A023
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
请分析样本 2707 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 2707
|
根据样本 2707 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：11,025,704
- 检出物种数：368
- Shannon多样性指数：4.088
- Simpson多样性指数：0.947
**二、优势菌群**
- Prevotella copri (15.1%)
- Faecalibacterium prausnitzii (14.2%)
- Ruminococcus bromii (5.2%)
- Wujia chipingensis (4.9%)
- Blautia wexlerae (2.4%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性良好，微生态状态相对健康。
|
2707
|
overview
|
basic
|
[
"Prevotella copri (15.1%)",
"Faecalibacterium prausnitzii (14.2%)",
"Ruminococcus bromii (5.2%)"
] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 2199
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Blautia wexlerae (8.7%)
- Ruminococcus bromii (6.8%)
- Phocaeicola vulgatus (6.5%)
- Blautia schinkii (4.8%)
- Bacteroides uniformis (4.7%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为4.139，表明菌群多样性非常高
- 物种丰富度：357个物种
**关键发现：**
- 菌群多样性良好，微生态平衡
|
2199
|
overview
|
basic
|
[
"Blautia wexlerae (8.7%)",
"Ruminococcus bromii (6.8%)",
"Phocaeicola vulgatus (6.5%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: ZYQC02-A012
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：4.056
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.969
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：898种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 急性感染状态
|
ZYQC02-A012
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
针对此微生物检测结果，应该采取什么治疗策略？
|
样本ID: JXEY06C005
|
治疗策略建议：
**一、主要关注病原体**
- Streptococcus pneumoniae（肺炎链球菌）- 风险等级：high
- Campylobacter concisus（简明弯曲杆菌）- 风险等级：low
- Fusobacterium nucleatum（具核梭杆菌）- 风险等级：medium
**二、经验性抗菌治疗建议**
- 以革兰阳性菌为主，首选：万古霉素或利奈唑胺（疑似MRSA时）
- 非耐药菌可选：苯唑西林或头孢唑林
**三、进一步检查建议**
- 药敏试验指导精准用药
- 炎症指标监测（CRP、PCT）
- 必要时重复微生物检测评估疗效
**四、治疗监测要点**
- 48-72小时评估临床反应
- 根据药敏结果降阶梯治疗
- 注意药物不良反应监测
**注意：** 治疗方案需结合患者临床症状、既往用药史及当地耐药流行病学数据综合制定。
|
JXEY06C005
|
clinical
|
advanced
|
[
"Streptococcus pneumoniae",
"Campylobacter concisus",
"Fusobacterium nucleatum"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 3122
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：1.404
多样性显著降低，提示可能存在明显菌群失调或优势菌过度增殖
- Simpson指数：0.502
中等均匀度，存在一定优势菌群
- 物种丰富度：232种
**菌群平衡状态评估：**
明显菌群失调，需进一步评估原因并考虑干预。
**可能原因分析：**
- 抗生素使用史
- 免疫功能低下
- 慢性疾病影响
|
3122
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
检测到 Campylobacter concisus，丰度为 0.77%，请评估其临床意义。
|
样本ID: JXEY02B010
|
Campylobacter concisus（简明弯曲杆菌）检测分析：
**1. 病原体特征**
- 检出丰度：0.77%
- 读数：528,533
- 致病类别：oral
- 临床风险等级：low
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低（<1%），可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状，仍需警惕；若无症状，可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 结合临床症状评估
2. 必要时进行药敏试验
3. 动态监测菌量变化
|
JXEY02B010
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Campylobacter concisus"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 6202
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：3.154
多样性良好，菌群结构相对平衡
- Simpson指数：0.942
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：44种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
6202
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 2466
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Bacteroides uniformis (6.6%)
- Phocaeicola vulgatus (6.6%)
- Bacteroides cellulosilyticus (6.1%)
- Barnesiella intestinihominis (3.7%)
- Faecalibacterium prausnitzii (3.6%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为4.474，表明菌群多样性非常高
- 物种丰富度：413个物种
**关键发现：**
- 菌群多样性良好，微生态平衡
|
2466
|
overview
|
basic
|
[
"Bacteroides uniformis (6.6%)",
"Phocaeicola vulgatus (6.6%)",
"Bacteroides cellulosilyticus (6.1%)"
] |
请分析样本 7509 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 7509
|
根据样本 7509 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：15,075,989
- 检出物种数：460
- Shannon多样性指数：3.941
- Simpson多样性指数：0.943
**二、优势菌群**
- Phocaeicola plebeius (18.2%)
- Megamonas funiformis (7.7%)
- Megamonas rupellensis (7.4%)
- Bacteroides ndongoniae (6.7%)
- Phocaeicola barnesiae (4.0%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性良好，微生态状态相对健康。
|
7509
|
overview
|
basic
|
[
"Phocaeicola plebeius (18.2%)",
"Megamonas funiformis (7.7%)",
"Megamonas rupellensis (7.4%)"
] |
请分析样本 476 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 476
|
根据样本 476 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：3,167,864
- 检出物种数：101
- Shannon多样性指数：0.765
- Simpson多样性指数：0.216
**二、优势菌群**
- Enterococcus faecalis (88.5%)
- Veillonella parvula (1.2%)
- Veillonella hominis (1.2%)
- Haemophilus parainfluenzae (1.1%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性显著降低，可能存在菌群失调，需关注潜在感染风险。
|
476
|
overview
|
basic
|
[
"Enterococcus faecalis (88.5%)",
"Veillonella parvula (1.2%)",
"Veillonella hominis (1.2%)"
] |
检测到 Streptococcus pneumoniae，丰度为 0.02%，请评估其临床意义。
|
样本ID: ZYQC06-A046
|
Streptococcus pneumoniae（肺炎链球菌）检测分析：
**1. 病原体特征**
- 检出丰度：0.02%
- 读数：15,076
- 致病类别：respiratory
- 临床风险等级：high
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低（<1%），可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状，仍需警惕；若无症状，可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 进行药敏试验指导用药
2. 根据感染部位选择合适抗菌方案
3. 密切监测治疗效果
|
ZYQC06-A046
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Streptococcus pneumoniae"
] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 2696
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Phocaeicola vulgatus (7.6%)
- Faecalibacterium prausnitzii (6.9%)
- Phocaeicola plebeius (4.0%)
- Bacteroides uniformis (3.8%)
- Wujia chipingensis (3.6%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为4.581，表明菌群多样性非常高
- 物种丰富度：354个物种
**关键发现：**
- 菌群多样性良好，微生态平衡
|
2696
|
overview
|
basic
|
[
"Phocaeicola vulgatus (7.6%)",
"Faecalibacterium prausnitzii (6.9%)",
"Phocaeicola plebeius (4.0%)"
] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 3961
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Phocaeicola dorei (15.7%)
- Blautia wexlerae (13.4%)
- Bacteroides uniformis (8.7%)
- Roseburia faecis (7.0%)
- Lachnospira eligens (4.6%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为3.436，表明菌群多样性良好
- 物种丰富度：254个物种
**关键发现：**
- 菌群多样性良好，微生态平衡
|
3961
|
overview
|
basic
|
[
"Phocaeicola dorei (15.7%)",
"Blautia wexlerae (13.4%)",
"Bacteroides uniformis (8.7%)"
] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 6
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Bacteroides stercoris (8.3%)
- Faecalibacterium prausnitzii (3.9%)
- Roseburia faecis (3.8%)
- Roseburia intestinalis (3.8%)
- [Ruminococcus] torques (3.7%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为4.547，表明菌群多样性非常高
- 物种丰富度：579个物种
**关键发现：**
- 菌群多样性良好，微生态平衡
|
6
|
overview
|
basic
|
[
"Bacteroides stercoris (8.3%)",
"Faecalibacterium prausnitzii (3.9%)",
"Roseburia faecis (3.8%)"
] |
检测到 Prevotella intermedia，丰度为 0.23%，请评估其临床意义。
|
样本ID: LJDX-01-A013
|
Prevotella intermedia（中间普雷沃菌）检测分析：
**1. 病原体特征**
- 检出丰度：0.23%
- 读数：193,376
- 致病类别：oral
- 临床风险等级：low
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低（<1%），可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状，仍需警惕；若无症状，可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 结合临床症状评估
2. 必要时进行药敏试验
3. 动态监测菌量变化
|
LJDX-01-A013
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Prevotella intermedia"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 251
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：4.072
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.963
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：453种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
251
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 2138
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：3.014
多样性良好，菌群结构相对平衡
- Simpson指数：0.915
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：276种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
2138
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: ZYQC03-A001
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Schaalia odontolytica (6.5%)
- Leptotrichia wadei (3.7%)
- Veillonella atypica (3.4%)
- Actinomyces bouchesdurhonensis (3.2%)
- Schaalia meyeri (2.9%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为5.13，表明菌群多样性非常高
- 物种丰富度：1456个物种
**关键发现：**
- 检出 16 种潜在病原体，需重点关注
- 菌群多样性良好，微生态平衡
|
ZYQC03-A001
|
overview
|
basic
|
[
"Schaalia odontolytica (6.5%)",
"Leptotrichia wadei (3.7%)",
"Veillonella atypica (3.4%)"
] |
请分析样本 3117 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 3117
|
根据样本 3117 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：21,103,554
- 检出物种数：347
- Shannon多样性指数：2.97
- Simpson多样性指数：0.873
**二、优势菌群**
- Phocaeicola dorei (27.6%)
- Bacteroides humanifaecis (18.3%)
- Akkermansia muciniphila (8.8%)
- Bacteroides uniformis (6.6%)
- Phocaeicola vulgatus (4.5%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性处于正常范围，建议定期监测。
|
3117
|
overview
|
basic
|
[
"Phocaeicola dorei (27.6%)",
"Bacteroides humanifaecis (18.3%)",
"Akkermansia muciniphila (8.8%)"
] |
检测到 Fusobacterium nucleatum，丰度为 2.18%，请评估其临床意义。
|
样本ID: JXEY07E024
|
Fusobacterium nucleatum（具核梭杆菌）检测分析：
**1. 病原体特征**
- 检出丰度：2.18%
- 读数：1,510,576
- 致病类别：oral
- 临床风险等级：medium
**2. 临床意义评估**
该菌丰度中等（2.2%），可能为致病原因或定植状态。需结合临床症状判断是否为病因。
**3. 建议措施**
1. 结合临床症状评估
2. 必要时进行药敏试验
3. 动态监测菌量变化
|
JXEY07E024
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Fusobacterium nucleatum"
] |
检测到 Streptococcus pneumoniae，丰度为 0.53%，请评估其临床意义。
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样本ID: ZYQC07-A011
|
Streptococcus pneumoniae（肺炎链球菌）检测分析：
**1. 病原体特征**
- 检出丰度：0.53%
- 读数：252,975
- 致病类别：respiratory
- 临床风险等级：high
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低（<1%），可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状，仍需警惕；若无症状，可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 进行药敏试验指导用药
2. 根据感染部位选择合适抗菌方案
3. 密切监测治疗效果
|
ZYQC07-A011
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Streptococcus pneumoniae"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 4248
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：2.594
多样性良好，菌群结构相对平衡
- Simpson指数：0.635
中等均匀度，存在一定优势菌群
- 物种丰富度：415种
**菌群平衡状态评估：**
菌群状态基本正常，持续监测即可。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
4248
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
请分析样本 7242 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 7242
|
根据样本 7242 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：10,180,616
- 检出物种数：192
- Shannon多样性指数：3.048
- Simpson多样性指数：0.892
**二、优势菌群**
- Bacteroides acidifaciens (26.0%)
- Lepagella muris (15.8%)
- Bacteroides caecimuris (6.3%)
- Duncaniella muris (5.4%)
- Bacteroides uniformis (4.3%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性良好，微生态状态相对健康。
|
7242
|
overview
|
basic
|
[
"Bacteroides acidifaciens (26.0%)",
"Lepagella muris (15.8%)",
"Bacteroides caecimuris (6.3%)"
] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 5124
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Acinetobacter johnsonii (7.5%)
- Acidovorax temperans (5.4%)
- Acidovorax carolinensis (4.9%)
- Cloacibacterium caeni (4.4%)
- Acidovorax soli (3.2%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为5.062，表明菌群多样性非常高
- 物种丰富度：942个物种
**关键发现：**
- 菌群多样性良好，微生态平衡
- 优势菌含潜在致病属（Acinetobacter），需警惕
|
5124
|
overview
|
basic
|
[
"Acinetobacter johnsonii (7.5%)",
"Acidovorax temperans (5.4%)",
"Acidovorax carolinensis (4.9%)"
] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 111
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Enterobacter cloacae (61.9%)
- Enterobacter hormaechei (9.5%)
- Shigella dysenteriae (3.2%)
- Escherichia coli (3.1%)
- Shigella flexneri (3.0%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为1.747，表明菌群多样性中等
- 物种丰富度：109个物种
**关键发现：**
- 菌群多样性偏低，可能存在菌群失调
|
111
|
overview
|
basic
|
[
"Enterobacter cloacae (61.9%)",
"Enterobacter hormaechei (9.5%)",
"Shigella dysenteriae (3.2%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 3566
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：4.611
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.978
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：586种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
3566
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 4379
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：4.879
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.981
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：1098种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
4379
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
针对此微生物检测结果，应该采取什么治疗策略？
|
样本ID: JXEY01C041
|
治疗策略建议：
**一、主要关注病原体**
- Campylobacter concisus（简明弯曲杆菌）- 风险等级：low
- Prevotella intermedia（中间普雷沃菌）- 风险等级：low
- Fusobacterium nucleatum（具核梭杆菌）- 风险等级：medium
**二、经验性抗菌治疗建议**
- 暂无需抗菌治疗
**三、进一步检查建议**
- 药敏试验指导精准用药
- 炎症指标监测（CRP、PCT）
- 必要时重复微生物检测评估疗效
**四、治疗监测要点**
- 48-72小时评估临床反应
- 根据药敏结果降阶梯治疗
- 注意药物不良反应监测
**注意：** 治疗方案需结合患者临床症状、既往用药史及当地耐药流行病学数据综合制定。
|
JXEY01C041
|
clinical
|
advanced
|
[
"Campylobacter concisus",
"Prevotella intermedia",
"Fusobacterium nucleatum"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: ZYZJ03-H004
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：4.126
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.964
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：941种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 急性感染状态
|
ZYZJ03-H004
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
检测到 Fusobacterium nucleatum，丰度为 0.00%，请评估其临床意义。
|
样本ID: NTC20250114-1
|
Fusobacterium nucleatum（具核梭杆菌）检测分析：
**1. 病原体特征**
- 检出丰度：0.00%
- 读数：148
- 致病类别：oral
- 临床风险等级：medium
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低（<1%），可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状，仍需警惕；若无症状，可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 结合临床症状评估
2. 必要时进行药敏试验
3. 动态监测菌量变化
|
NTC20250114-1
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Fusobacterium nucleatum"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 931
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：3.768
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.938
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：472种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
931
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
检测到 Fusobacterium nucleatum，丰度为 0.29%，请评估其临床意义。
|
样本ID: JXEY01A001
|
Fusobacterium nucleatum（具核梭杆菌）检测分析：
**1. 病原体特征**
- 检出丰度：0.29%
- 读数：152,742
- 致病类别：oral
- 临床风险等级：medium
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低（<1%），可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状，仍需警惕；若无症状，可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 结合临床症状评估
2. 必要时进行药敏试验
3. 动态监测菌量变化
|
JXEY01A001
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Fusobacterium nucleatum"
] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 123
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Prevotella copri (14.6%)
- Klebsiella oxytoca (8.9%)
- Klebsiella michiganensis (7.9%)
- Anaerostipes hadrus (3.9%)
- Phocaeicola vulgatus (3.6%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为4.109，表明菌群多样性非常高
- 物种丰富度：290个物种
**关键发现：**
- 菌群多样性良好，微生态平衡
- 优势菌为常驻菌群（Prevotella属），总体正常
|
123
|
overview
|
basic
|
[
"Prevotella copri (14.6%)",
"Klebsiella oxytoca (8.9%)",
"Klebsiella michiganensis (7.9%)"
] |
请分析样本 344 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 344
|
根据样本 344 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：3,725,525
- 检出物种数：284
- Shannon多样性指数：3.438
- Simpson多样性指数：0.932
**二、优势菌群**
- Escherichia coli (12.6%)
- Shigella dysenteriae (12.1%)
- Shigella flexneri (11.0%)
- Shigella sonnei (9.4%)
- Anaerostipes hadrus (8.1%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性良好，微生态状态相对健康。
|
344
|
overview
|
basic
|
[
"Escherichia coli (12.6%)",
"Shigella dysenteriae (12.1%)",
"Shigella flexneri (11.0%)"
] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 2226
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Phocaeicola vulgatus (20.7%)
- Faecalibacterium prausnitzii (10.7%)
- Bacteroides thetaiotaomicron (9.1%)
- Phocaeicola dorei (4.3%)
- Bacteroides stercoris (3.3%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为3.747，表明菌群多样性非常高
- 物种丰富度：353个物种
**关键发现：**
- 菌群多样性良好，微生态平衡
|
2226
|
overview
|
basic
|
[
"Phocaeicola vulgatus (20.7%)",
"Faecalibacterium prausnitzii (10.7%)",
"Bacteroides thetaiotaomicron (9.1%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: JXEY02A034
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：4.78
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.982
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：1533种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 急性感染状态
|
JXEY02A034
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
请分析样本 3611 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 3611
|
根据样本 3611 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：30,252,069
- 检出物种数：539
- Shannon多样性指数：4.308
- Simpson多样性指数：0.976
**二、优势菌群**
- Phocaeicola plebeius (5.6%)
- Citrobacter youngae (5.0%)
- Citrobacter portucalensis (4.6%)
- Blautia wexlerae (4.4%)
- Citrobacter braakii (4.3%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性良好，微生态状态相对健康。
|
3611
|
overview
|
basic
|
[
"Phocaeicola plebeius (5.6%)",
"Citrobacter youngae (5.0%)",
"Citrobacter portucalensis (4.6%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 3165
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：3.935
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.964
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：518种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
3165
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: ZYZJ02-A031
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：4.611
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.977
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：732种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 急性感染状态
|
ZYZJ02-A031
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 5871
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：5.3
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.993
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：356种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
5871
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 2669
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：4.248
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.969
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：364种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
2669
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
请分析样本 7367 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 7367
|
根据样本 7367 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：6,251,241
- 检出物种数：279
- Shannon多样性指数：3.561
- Simpson多样性指数：0.889
**二、优势菌群**
- Bacteroides eggerthii (31.3%)
- Bacteroides uniformis (6.4%)
- Bacteroides cellulosilyticus (3.8%)
- Bacteroides fragilis (3.3%)
- Phocaeicola vulgatus (2.8%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性良好，微生态状态相对健康。
|
7367
|
overview
|
basic
|
[
"Bacteroides eggerthii (31.3%)",
"Bacteroides uniformis (6.4%)",
"Bacteroides cellulosilyticus (3.8%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 190
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：3.535
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.931
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：636种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
190
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 4741
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：6.62
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.996
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：1941种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
4741
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 3379
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Faecalibacterium prausnitzii (19.1%)
- Faecalibacterium longum (16.5%)
- Odoribacter splanchnicus (9.3%)
- Shigella dysenteriae (4.5%)
- Shigella flexneri (4.5%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为3.382，表明菌群多样性良好
- 物种丰富度：452个物种
**关键发现：**
- 菌群多样性良好，微生态平衡
|
3379
|
overview
|
basic
|
[
"Faecalibacterium prausnitzii (19.1%)",
"Faecalibacterium longum (16.5%)",
"Odoribacter splanchnicus (9.3%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 1093
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：3.467
多样性良好，菌群结构相对平衡
- Simpson指数：0.925
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：1216种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
1093
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 1594
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：4.438
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.973
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：444种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
1594
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 3875
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：2.771
多样性良好，菌群结构相对平衡
- Simpson指数：0.895
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：228种
**菌群平衡状态评估：**
菌群状态基本正常，持续监测即可。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
3875
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
请分析样本 1374 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 1374
|
根据样本 1374 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：267,642,148
- 检出物种数：450
- Shannon多样性指数：0.81
- Simpson多样性指数：0.289
**二、优势菌群**
- Enterococcus avium (83.9%)
- Parabacteroides faecis (7.5%)
- Streptococcus parasanguinis (2.6%)
- Enterococcus raffinosus (1.8%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性显著降低，可能存在菌群失调，需关注潜在感染风险。
|
1374
|
overview
|
basic
|
[
"Enterococcus avium (83.9%)",
"Parabacteroides faecis (7.5%)",
"Streptococcus parasanguinis (2.6%)"
] |
请分析样本 811 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 811
|
根据样本 811 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：18,060,203
- 检出物种数：502
- Shannon多样性指数：4.417
- Simpson多样性指数：0.954
**二、优势菌群**
- Prevotella copri (19.0%)
- Faecalibacterium prausnitzii (4.1%)
- Streptococcus salivarius (3.6%)
- Ruminococcus bromii (2.8%)
- Prevotella hominis (2.7%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性良好，微生态状态相对健康。
|
811
|
overview
|
basic
|
[
"Prevotella copri (19.0%)",
"Faecalibacterium prausnitzii (4.1%)",
"Streptococcus salivarius (3.6%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 746
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：5.329
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.988
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：13445种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
746
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 569
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：4.148
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.962
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：487种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
569
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: ZYYH02-A026
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：4.879
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.984
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：1354种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 急性感染状态
|
ZYYH02-A026
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 1535
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：3.539
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.949
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：254种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
1535
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
检测到 Fusobacterium nucleatum，丰度为 0.41%，请评估其临床意义。
|
样本ID: ZYZJ06-A026
|
Fusobacterium nucleatum（具核梭杆菌）检测分析：
**1. 病原体特征**
- 检出丰度：0.41%
- 读数：282,805
- 致病类别：oral
- 临床风险等级：medium
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低（<1%），可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状，仍需警惕；若无症状，可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 结合临床症状评估
2. 必要时进行药敏试验
3. 动态监测菌量变化
|
ZYZJ06-A026
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Fusobacterium nucleatum"
] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 220
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Prevotella copri (32.4%)
- Phocaeicola vulgatus (9.3%)
- Faecalibacterium prausnitzii (5.2%)
- Prevotella hominis (3.9%)
- Blautia wexlerae (3.4%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为3.34，表明菌群多样性良好
- 物种丰富度：227个物种
**关键发现：**
- 菌群多样性良好，微生态平衡
- 优势菌为常驻菌群（Prevotella属），总体正常
|
220
|
overview
|
basic
|
[
"Prevotella copri (32.4%)",
"Phocaeicola vulgatus (9.3%)",
"Faecalibacterium prausnitzii (5.2%)"
] |
针对此微生物检测结果，应该采取什么治疗策略？
|
样本ID: JXEY01C002
|
治疗策略建议：
**一、主要关注病原体**
- Fusobacterium nucleatum（具核梭杆菌）- 风险等级：medium
- Streptococcus pneumoniae（肺炎链球菌）- 风险等级：high
- Campylobacter concisus（简明弯曲杆菌）- 风险等级：low
**二、经验性抗菌治疗建议**
- 以革兰阳性菌为主，首选：万古霉素或利奈唑胺（疑似MRSA时）
- 非耐药菌可选：苯唑西林或头孢唑林
**三、进一步检查建议**
- 药敏试验指导精准用药
- 炎症指标监测（CRP、PCT）
- 必要时重复微生物检测评估疗效
**四、治疗监测要点**
- 48-72小时评估临床反应
- 根据药敏结果降阶梯治疗
- 注意药物不良反应监测
**注意：** 治疗方案需结合患者临床症状、既往用药史及当地耐药流行病学数据综合制定。
|
JXEY01C002
|
clinical
|
advanced
|
[
"Fusobacterium nucleatum",
"Streptococcus pneumoniae",
"Campylobacter concisus"
] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 6514
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Sus scrofa (24.4%)
- Neospora caninum (21.1%)
- Parvularcula marina (21.0%)
- Nesterenkonia natronophila (18.8%)
- Alteribacter natronophilus (7.9%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为1.956，表明菌群多样性中等
- 物种丰富度：134个物种
**关键发现：**
- 菌群多样性偏低，可能存在菌群失调
|
6514
|
overview
|
basic
|
[
"Sus scrofa (24.4%)",
"Neospora caninum (21.1%)",
"Parvularcula marina (21.0%)"
] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: JXEY06C006
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Nocardioides agariphilus (7.9%)
- Lysobacter prati (7.6%)
- Prevotella jejuni (5.0%)
- Ramlibacter humi (4.7%)
- Streptococcus mitis (4.6%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为4.524，表明菌群多样性非常高
- 物种丰富度：931个物种
**关键发现：**
- 检出 14 种潜在病原体，需重点关注
- 菌群多样性良好，微生态平衡
|
JXEY06C006
|
overview
|
basic
|
[
"Nocardioides agariphilus (7.9%)",
"Lysobacter prati (7.6%)",
"Prevotella jejuni (5.0%)"
] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: PTC20250122-2
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Arabidopsis thaliana (70.3%)
- Pan troglodytes (7.6%)
- Actinomadura cremea (2.8%)
- Chlorocebus aethiops (2.0%)
- Pongo abelii (1.6%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为1.54，表明菌群多样性中等
- 物种丰富度：190个物种
**关键发现：**
- 检出 2 种潜在病原体，需重点关注
- 菌群多样性偏低，可能存在菌群失调
|
PTC20250122-2
|
overview
|
basic
|
[
"Arabidopsis thaliana (70.3%)",
"Pan troglodytes (7.6%)",
"Actinomadura cremea (2.8%)"
] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 4612
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Polynucleobacter yangtzensis (7.3%)
- Polynucleobacter necessarius (5.2%)
- Polynucleobacter asymbioticus (3.9%)
- Limnohabitans curvus (3.5%)
- Polynucleobacter parvulilacunae (3.4%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为5.399，表明菌群多样性非常高
- 物种丰富度：1182个物种
**关键发现：**
- 菌群多样性良好，微生态平衡
|
4612
|
overview
|
basic
|
[
"Polynucleobacter yangtzensis (7.3%)",
"Polynucleobacter necessarius (5.2%)",
"Polynucleobacter asymbioticus (3.9%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 6110
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：4.085
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.966
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：215种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
6110
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 4916
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：5.427
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.986
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：619种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
4916
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 4456
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：1.615
多样性中等，菌群结构相对集中
- Simpson指数：0.419
优势度高，少数物种占主导地位
- 物种丰富度：720种
**菌群平衡状态评估：**
菌群状态基本正常，持续监测即可。
**可能原因分析：**
- 抗生素使用史
- 免疫功能低下
- 慢性疾病影响
|
4456
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
针对此微生物检测结果，应该采取什么治疗策略？
|
样本ID: ZYYH02-A008
|
治疗策略建议：
**一、主要关注病原体**
- Campylobacter concisus（简明弯曲杆菌）- 风险等级：low
- Streptococcus pneumoniae（肺炎链球菌）- 风险等级：high
- Fusobacterium nucleatum（具核梭杆菌）- 风险等级：medium
**二、经验性抗菌治疗建议**
- 以革兰阳性菌为主，首选：万古霉素或利奈唑胺（疑似MRSA时）
- 非耐药菌可选：苯唑西林或头孢唑林
**三、进一步检查建议**
- 药敏试验指导精准用药
- 炎症指标监测（CRP、PCT）
- 必要时重复微生物检测评估疗效
**四、治疗监测要点**
- 48-72小时评估临床反应
- 根据药敏结果降阶梯治疗
- 注意药物不良反应监测
**注意：** 治疗方案需结合患者临床症状、既往用药史及当地耐药流行病学数据综合制定。
|
ZYYH02-A008
|
clinical
|
advanced
|
[
"Campylobacter concisus",
"Streptococcus pneumoniae",
"Fusobacterium nucleatum"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 3167
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：2.247
多样性中等，菌群结构相对集中
- Simpson指数：0.632
中等均匀度，存在一定优势菌群
- 物种丰富度：325种
**菌群平衡状态评估：**
菌群状态基本正常，持续监测即可。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
3167
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
针对此微生物检测结果，应该采取什么治疗策略？
|
样本ID: ZYQC06-A049
|
治疗策略建议：
**一、主要关注病原体**
- Streptococcus pneumoniae（肺炎链球菌）- 风险等级：high
- Fusobacterium nucleatum（具核梭杆菌）- 风险等级：medium
- Campylobacter concisus（简明弯曲杆菌）- 风险等级：low
**二、经验性抗菌治疗建议**
- 检出革兰阳性和革兰阴性菌，建议广谱抗菌治疗
- 可选：哌拉西林/他唑巴坦、头孢哌酮/舒巴坦或碳青霉烯类
**三、进一步检查建议**
- 药敏试验指导精准用药
- 炎症指标监测（CRP、PCT）
- 必要时重复微生物检测评估疗效
**四、治疗监测要点**
- 48-72小时评估临床反应
- 根据药敏结果降阶梯治疗
- 注意药物不良反应监测
**注意：** 治疗方案需结合患者临床症状、既往用药史及当地耐药流行病学数据综合制定。
|
ZYQC06-A049
|
clinical
|
advanced
|
[
"Streptococcus pneumoniae",
"Fusobacterium nucleatum",
"Campylobacter concisus"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 7333
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：3.727
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.936
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：471种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
7333
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
请分析样本 5283 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 5283
|
根据样本 5283 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：26,563,199
- 检出物种数：412
- Shannon多样性指数：3.827
- Simpson多样性指数：0.949
**二、优势菌群**
- Rhodococcus rhodochrous (13.2%)
- Rhodococcus pyridinivorans (12.3%)
- Hydrogenophaga intermedia (5.8%)
- Paracoccus pantotrophus (5.7%)
- Aquamicrobium defluvii (5.5%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性良好，微生态状态相对健康。
|
5283
|
overview
|
basic
|
[
"Rhodococcus rhodochrous (13.2%)",
"Rhodococcus pyridinivorans (12.3%)",
"Hydrogenophaga intermedia (5.8%)"
] |
检测到 Fusobacterium nucleatum，丰度为 0.02%，请评估其临床意义。
|
样本ID: JXEY07A010
|
Fusobacterium nucleatum（具核梭杆菌）检测分析：
**1. 病原体特征**
- 检出丰度：0.02%
- 读数：15,240
- 致病类别：oral
- 临床风险等级：medium
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低（<1%），可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状，仍需警惕；若无症状，可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 结合临床症状评估
2. 必要时进行药敏试验
3. 动态监测菌量变化
|
JXEY07A010
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Fusobacterium nucleatum"
] |
检测到 Staphylococcus aureus，丰度为 0.76%，请评估其临床意义。
|
样本ID: PTC20250106-3
|
Staphylococcus aureus（金黄色葡萄球菌）检测分析：
**1. 病原体特征**
- 检出丰度：0.76%
- 读数：16,268
- 致病类别：skin
- 临床风险等级：high
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低（<1%），可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状，仍需警惕；若无症状，可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 进行药敏试验指导用药
2. 根据感染部位选择合适抗菌方案
3. 密切监测治疗效果
|
PTC20250106-3
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Staphylococcus aureus"
] |
检测到 Streptococcus pneumoniae，丰度为 0.42%，请评估其临床意义。
|
样本ID: ZYYH05-A008
|
Streptococcus pneumoniae（肺炎链球菌）检测分析：
**1. 病原体特征**
- 检出丰度：0.42%
- 读数：286,822
- 致病类别：respiratory
- 临床风险等级：high
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低（<1%），可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状，仍需警惕；若无症状，可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 进行药敏试验指导用药
2. 根据感染部位选择合适抗菌方案
3. 密切监测治疗效果
|
ZYYH05-A008
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Streptococcus pneumoniae"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 2988
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：1.835
多样性中等，菌群结构相对集中
- Simpson指数：0.688
中等均匀度，存在一定优势菌群
- 物种丰富度：248种
**菌群平衡状态评估：**
菌群状态基本正常，持续监测即可。
**可能原因分析：**
- 抗生素使用史
- 免疫功能低下
- 慢性疾病影响
|
2988
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
请分析样本 1323 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 1323
|
根据样本 1323 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：18,249,536
- 检出物种数：449
- Shannon多样性指数：4.356
- Simpson多样性指数：0.972
**二、优势菌群**
- Megamonas funiformis (9.5%)
- Prevotella copri (6.4%)
- Megamonas rupellensis (4.7%)
- Blautia wexlerae (4.6%)
- Roseburia inulinivorans (4.4%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性良好，微生态状态相对健康。
|
1323
|
overview
|
basic
|
[
"Megamonas funiformis (9.5%)",
"Prevotella copri (6.4%)",
"Megamonas rupellensis (4.7%)"
] |
请分析样本 3300 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 3300
|
根据样本 3300 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：17,386,795
- 检出物种数：251
- Shannon多样性指数：2.321
- Simpson多样性指数：0.785
**二、优势菌群**
- Phocaeicola vulgatus (41.6%)
- Parabacteroides distasonis (15.5%)
- Phocaeicola dorei (8.8%)
- Akkermansia muciniphila (6.9%)
- Bacteroides fragilis (5.2%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性处于正常范围，建议定期监测。
|
3300
|
overview
|
basic
|
[
"Phocaeicola vulgatus (41.6%)",
"Parabacteroides distasonis (15.5%)",
"Phocaeicola dorei (8.8%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 5763
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：0.93
多样性显著降低，提示可能存在明显菌群失调或优势菌过度增殖
- Simpson指数：0.554
中等均匀度，存在一定优势菌群
- 物种丰富度：18种
**菌群平衡状态评估：**
明显菌群失调，需进一步评估原因并考虑干预。
**可能原因分析：**
- 抗生素使用史
- 免疫功能低下
- 慢性疾病影响
|
5763
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
检测到 Campylobacter concisus，丰度为 0.20%，请评估其临床意义。
|
样本ID: JXEY07A006
|
Campylobacter concisus（简明弯曲杆菌）检测分析：
**1. 病原体特征**
- 检出丰度：0.20%
- 读数：144,587
- 致病类别：oral
- 临床风险等级：low
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低（<1%），可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状，仍需警惕；若无症状，可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 结合临床症状评估
2. 必要时进行药敏试验
3. 动态监测菌量变化
|
JXEY07A006
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Campylobacter concisus"
] |
针对此微生物检测结果，应该采取什么治疗策略？
|
样本ID: ZYZJ02-A017
|
治疗策略建议：
**一、主要关注病原体**
- Fusobacterium nucleatum（具核梭杆菌）- 风险等级：medium
- Streptococcus pneumoniae（肺炎链球菌）- 风险等级：high
- Campylobacter concisus（简明弯曲杆菌）- 风险等级：low
**二、经验性抗菌治疗建议**
- 以革兰阳性菌为主，首选：万古霉素或利奈唑胺（疑似MRSA时）
- 非耐药菌可选：苯唑西林或头孢唑林
**三、进一步检查建议**
- 药敏试验指导精准用药
- 炎症指标监测（CRP、PCT）
- 必要时重复微生物检测评估疗效
**四、治疗监测要点**
- 48-72小时评估临床反应
- 根据药敏结果降阶梯治疗
- 注意药物不良反应监测
**注意：** 治疗方案需结合患者临床症状、既往用药史及当地耐药流行病学数据综合制定。
|
ZYZJ02-A017
|
clinical
|
advanced
|
[
"Fusobacterium nucleatum",
"Streptococcus pneumoniae",
"Campylobacter concisus"
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该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
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样本ID: 1410
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样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Natronogracilivirga saccharolytica (19.2%)
- Fusicatenibacter saccharivorans (12.1%)
- [Ruminococcus] torques (11.9%)
- Phocaeicola dorei (11.5%)
- Prevotella pectinovora (10.1%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为2.383，表明菌群多样性中等
- 物种丰富度：13个物种
**关键发现：**
- 无特殊发现
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1410
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overview
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basic
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"Natronogracilivirga saccharolytica (19.2%)",
"Fusicatenibacter saccharivorans (12.1%)",
"[Ruminococcus] torques (11.9%)"
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