instruction
stringlengths 19
61
| input
stringlengths 7
34
| output
stringlengths 132
823
| sample_id
stringlengths 1
28
| question_type
stringclasses 4
values | difficulty
stringclasses 3
values | species_involved
listlengths 0
3
|
|---|---|---|---|---|---|---|
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: NTC20250115-1
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Arabidopsis halleri (25.2%)
- Pan troglodytes (16.7%)
- Arabidopsis thaliana (8.4%)
- Actinomadura cremea (8.0%)
- Chlorocebus aethiops (4.2%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为2.822，表明菌群多样性良好
- 物种丰富度：227个物种
**关键发现：**
- 检出 1 种潜在病原体，需重点关注
|
NTC20250115-1
|
overview
|
basic
|
[
"Arabidopsis halleri (25.2%)",
"Pan troglodytes (16.7%)",
"Arabidopsis thaliana (8.4%)"
] |
请分析样本 JXEY01C002 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: JXEY01C002
|
根据样本 JXEY01C002 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：79,590,439
- 检出物种数：1738
- Shannon多样性指数：4.863
- Simpson多样性指数：0.981
**二、优势菌群**
- Prevotella melaninogenica (7.1%)
- Streptococcus mitis (5.7%)
- Streptococcus oralis (4.3%)
- Streptococcus gwangjuense (3.8%)
- Schaalia odontolytica (3.4%)
**三、检出病原体情况**
检出 10 种潜在病原体：
- Fusobacterium nucleatum
- Streptococcus pneumoniae
- Campylobacter concisus
- Neisseria meningitidis
- Tannerella forsythia
- Porphyromonas gingivalis
- Enterococcus faecium
- Treponema denticola
- Cutibacterium acnes
- Legionella pneumophila
**四、总体评估**
菌群多样性良好，微生态状态相对健康。
|
JXEY01C002
|
overview
|
basic
|
[
"Prevotella melaninogenica (7.1%)",
"Streptococcus mitis (5.7%)",
"Streptococcus oralis (4.3%)"
] |
检测到 Neisseria meningitidis，丰度为 0.20%，请评估其临床意义。
|
样本ID: ZYYH02-A026
|
Neisseria meningitidis（脑膜炎奈瑟菌）检测分析：
**1. 病原体特征**
- 检出丰度：0.20%
- 读数：155,036
- 致病类别：systemic
- 临床风险等级：critical
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低（<1%），可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状，仍需警惕；若无症状，可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 立即进行确认检测
2. 启动感染控制措施
3. 进行药敏试验
4. 考虑会诊感染科
|
ZYYH02-A026
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Neisseria meningitidis"
] |
请分析样本 3488 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 3488
|
根据样本 3488 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：16,283,771
- 检出物种数：344
- Shannon多样性指数：3.112
- Simpson多样性指数：0.848
**二、优势菌群**
- Prevotella copri (36.1%)
- Phocaeicola vulgatus (10.9%)
- Dialister invisus (4.9%)
- Bacteroides xylanisolvens (3.8%)
- Prevotella hominis (3.2%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性良好，微生态状态相对健康。
|
3488
|
overview
|
basic
|
[
"Prevotella copri (36.1%)",
"Phocaeicola vulgatus (10.9%)",
"Dialister invisus (4.9%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 4171
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：4.216
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.966
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：400种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
4171
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
检测到 Fusobacterium nucleatum，丰度为 0.11%，请评估其临床意义。
|
样本ID: ZYYH02-H004
|
Fusobacterium nucleatum（具核梭杆菌）检测分析：
**1. 病原体特征**
- 检出丰度：0.11%
- 读数：57,736
- 致病类别：oral
- 临床风险等级：medium
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低（<1%），可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状，仍需警惕；若无症状，可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 结合临床症状评估
2. 必要时进行药敏试验
3. 动态监测菌量变化
|
ZYYH02-H004
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Fusobacterium nucleatum"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: JXEY05A012
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：5.084
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.985
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：1720种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 急性感染状态
|
JXEY05A012
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 5505
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：2.239
多样性中等，菌群结构相对集中
- Simpson指数：0.714
中等均匀度，存在一定优势菌群
- 物种丰富度：413种
**菌群平衡状态评估：**
菌群状态基本正常，持续监测即可。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
5505
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 3507
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：3.1
多样性良好，菌群结构相对平衡
- Simpson指数：0.849
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：416种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
3507
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 61
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：4.394
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.968
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：482种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
61
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 809
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Prevotella copri (20.9%)
- Prevotella hominis (7.9%)
- Faecalibacterium prausnitzii (6.2%)
- Wujia chipingensis (2.7%)
- Lachnospira pectinoschiza (2.3%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为4.285，表明菌群多样性非常高
- 物种丰富度：541个物种
**关键发现：**
- 菌群多样性良好，微生态平衡
- 优势菌为常驻菌群（Prevotella属），总体正常
|
809
|
overview
|
basic
|
[
"Prevotella copri (20.9%)",
"Prevotella hominis (7.9%)",
"Faecalibacterium prausnitzii (6.2%)"
] |
针对此微生物检测结果，应该采取什么治疗策略？
|
样本ID: LJDX-02-A024
|
治疗策略建议：
**一、主要关注病原体**
- Campylobacter concisus（简明弯曲杆菌）- 风险等级：low
- Fusobacterium nucleatum（具核梭杆菌）- 风险等级：medium
- Streptococcus pneumoniae（肺炎链球菌）- 风险等级：high
**二、经验性抗菌治疗建议**
- 以革兰阳性菌为主，首选：万古霉素或利奈唑胺（疑似MRSA时）
- 非耐药菌可选：苯唑西林或头孢唑林
**三、进一步检查建议**
- 药敏试验指导精准用药
- 炎症指标监测（CRP、PCT）
- 必要时重复微生物检测评估疗效
**四、治疗监测要点**
- 48-72小时评估临床反应
- 根据药敏结果降阶梯治疗
- 注意药物不良反应监测
**注意：** 治疗方案需结合患者临床症状、既往用药史及当地耐药流行病学数据综合制定。
|
LJDX-02-A024
|
clinical
|
advanced
|
[
"Campylobacter concisus",
"Fusobacterium nucleatum",
"Streptococcus pneumoniae"
] |
检测到 Campylobacter concisus，丰度为 0.11%，请评估其临床意义。
|
样本ID: JXEY04C027
|
Campylobacter concisus（简明弯曲杆菌）检测分析：
**1. 病原体特征**
- 检出丰度：0.11%
- 读数：57,507
- 致病类别：oral
- 临床风险等级：low
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低（<1%），可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状，仍需警惕；若无症状，可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 结合临床症状评估
2. 必要时进行药敏试验
3. 动态监测菌量变化
|
JXEY04C027
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Campylobacter concisus"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 3159
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：2.626
多样性良好，菌群结构相对平衡
- Simpson指数：0.818
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：335种
**菌群平衡状态评估：**
菌群状态基本正常，持续监测即可。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
3159
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: JXEY07E020
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：4.648
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.976
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：1294种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 急性感染状态
|
JXEY07E020
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 84
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：3.946
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.953
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：781种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
84
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
请分析样本 1086 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 1086
|
根据样本 1086 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：13,044,750
- 检出物种数：347
- Shannon多样性指数：4.082
- Simpson多样性指数：0.957
**二、优势菌群**
- Faecalibacterium prausnitzii (12.7%)
- Blautia wexlerae (11.0%)
- Gemmiger formicilis (6.8%)
- Phocaeicola dorei (4.0%)
- Bacteroides stercoris (3.9%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性良好，微生态状态相对健康。
|
1086
|
overview
|
basic
|
[
"Faecalibacterium prausnitzii (12.7%)",
"Blautia wexlerae (11.0%)",
"Gemmiger formicilis (6.8%)"
] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 1166
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Bifidobacterium adolescentis (6.9%)
- Bifidobacterium faecale (6.6%)
- Gemmiger formicilis (6.6%)
- Citrobacter braakii (3.0%)
- Bifidobacterium bifidum (3.0%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为4.71，表明菌群多样性非常高
- 物种丰富度：593个物种
**关键发现：**
- 菌群多样性良好，微生态平衡
|
1166
|
overview
|
basic
|
[
"Bifidobacterium adolescentis (6.9%)",
"Bifidobacterium faecale (6.6%)",
"Gemmiger formicilis (6.6%)"
] |
针对此微生物检测结果，应该采取什么治疗策略？
|
样本ID: JXEY04C040
|
治疗策略建议：
**一、主要关注病原体**
- Streptococcus pneumoniae（肺炎链球菌）- 风险等级：high
- Fusobacterium nucleatum（具核梭杆菌）- 风险等级：medium
- Campylobacter concisus（简明弯曲杆菌）- 风险等级：low
**二、经验性抗菌治疗建议**
- 以革兰阳性菌为主，首选：万古霉素或利奈唑胺（疑似MRSA时）
- 非耐药菌可选：苯唑西林或头孢唑林
**三、进一步检查建议**
- 药敏试验指导精准用药
- 炎症指标监测（CRP、PCT）
- 必要时重复微生物检测评估疗效
**四、治疗监测要点**
- 48-72小时评估临床反应
- 根据药敏结果降阶梯治疗
- 注意药物不良反应监测
**注意：** 治疗方案需结合患者临床症状、既往用药史及当地耐药流行病学数据综合制定。
|
JXEY04C040
|
clinical
|
advanced
|
[
"Streptococcus pneumoniae",
"Fusobacterium nucleatum",
"Campylobacter concisus"
] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 5878
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Thiobacillus thioparus (5.1%)
- Bradyrhizobium sediminis (2.0%)
- Sulfuricaulis limicola (1.8%)
- Kocuria polaris (1.7%)
- Thiobacillus denitrificans (1.6%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为5.581，表明菌群多样性非常高
- 物种丰富度：535个物种
**关键发现：**
- 菌群多样性良好，微生态平衡
|
5878
|
overview
|
basic
|
[
"Thiobacillus thioparus (5.1%)",
"Bradyrhizobium sediminis (2.0%)",
"Sulfuricaulis limicola (1.8%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: JXEY02B006
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：4.528
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.969
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：1725种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 急性感染状态
|
JXEY02B006
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
请分析样本 194 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 194
|
根据样本 194 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：2,755,837
- 检出物种数：286
- Shannon多样性指数：1.196
- Simpson多样性指数：0.625
**二、优势菌群**
- Enterococcus faecalis (42.4%)
- Clostridium paraputrificum (42.4%)
- Clostridioides difficile (12.5%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性显著降低，可能存在菌群失调，需关注潜在感染风险。
|
194
|
overview
|
basic
|
[
"Enterococcus faecalis (42.4%)",
"Clostridium paraputrificum (42.4%)",
"Clostridioides difficile (12.5%)"
] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: ZYYH06-A003
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Nocardioides agariphilus (4.1%)
- Rothia mucilaginosa (3.9%)
- Lysobacter prati (3.6%)
- Neisseria subflava (2.8%)
- Ramlibacter humi (2.8%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为4.93，表明菌群多样性非常高
- 物种丰富度：1147个物种
**关键发现：**
- 检出 10 种潜在病原体，需重点关注
- 菌群多样性良好，微生态平衡
|
ZYYH06-A003
|
overview
|
basic
|
[
"Nocardioides agariphilus (4.1%)",
"Rothia mucilaginosa (3.9%)",
"Lysobacter prati (3.6%)"
] |
请分析样本 6492 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 6492
|
根据样本 6492 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：2,006,490
- 检出物种数：50
- Shannon多样性指数：1.699
- Simpson多样性指数：0.779
**二、优势菌群**
- Parvularcula marina (29.4%)
- Sus scrofa (25.1%)
- Nesterenkonia natronophila (20.4%)
- Neospora caninum (16.7%)
- Alteribacter natronophilus (4.0%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性处于正常范围，建议定期监测。
|
6492
|
overview
|
basic
|
[
"Parvularcula marina (29.4%)",
"Sus scrofa (25.1%)",
"Nesterenkonia natronophila (20.4%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 2698
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：4.615
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.978
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：453种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
2698
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
请分析样本 2106 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 2106
|
根据样本 2106 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：30,101,516
- 检出物种数：359
- Shannon多样性指数：3.571
- Simpson多样性指数：0.942
**二、优势菌群**
- Phocaeicola plebeius (14.9%)
- Bifidobacterium catenulatum (9.7%)
- Bacteroides fragilis (8.1%)
- Bifidobacterium breve (7.6%)
- Roseburia faecis (6.6%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性良好，微生态状态相对健康。
|
2106
|
overview
|
basic
|
[
"Phocaeicola plebeius (14.9%)",
"Bifidobacterium catenulatum (9.7%)",
"Bacteroides fragilis (8.1%)"
] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 1836
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Prevotella copri (42.4%)
- Prevotella hominis (20.6%)
- Faecalibacterium prausnitzii (1.5%)
- Prevotella lascolaii (1.4%)
- Phocaeicola plebeius (1.3%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为2.725，表明菌群多样性良好
- 物种丰富度：371个物种
**关键发现：**
- 优势菌为常驻菌群（Prevotella属），总体正常
|
1836
|
overview
|
basic
|
[
"Prevotella copri (42.4%)",
"Prevotella hominis (20.6%)",
"Faecalibacterium prausnitzii (1.5%)"
] |
请分析样本 7095 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 7095
|
根据样本 7095 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：2,184,877
- 检出物种数：72
- Shannon多样性指数：1.742
- Simpson多样性指数：0.78
**二、优势菌群**
- Parvularcula marina (32.6%)
- Nesterenkonia natronophila (20.8%)
- Neospora caninum (19.5%)
- Sus scrofa (17.1%)
- Alteribacter natronophilus (5.3%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性处于正常范围，建议定期监测。
|
7095
|
overview
|
basic
|
[
"Parvularcula marina (32.6%)",
"Nesterenkonia natronophila (20.8%)",
"Neospora caninum (19.5%)"
] |
针对此微生物检测结果，应该采取什么治疗策略？
|
样本ID: ZYZJ05-A039
|
治疗策略建议：
**一、主要关注病原体**
- Fusobacterium nucleatum（具核梭杆菌）- 风险等级：medium
- Campylobacter concisus（简明弯曲杆菌）- 风险等级：low
- Prevotella intermedia（中间普雷沃菌）- 风险等级：low
**二、经验性抗菌治疗建议**
- 以革兰阳性菌为主，首选：万古霉素或利奈唑胺（疑似MRSA时）
- 非耐药菌可选：苯唑西林或头孢唑林
**三、进一步检查建议**
- 药敏试验指导精准用药
- 炎症指标监测（CRP、PCT）
- 必要时重复微生物检测评估疗效
**四、治疗监测要点**
- 48-72小时评估临床反应
- 根据药敏结果降阶梯治疗
- 注意药物不良反应监测
**注意：** 治疗方案需结合患者临床症状、既往用药史及当地耐药流行病学数据综合制定。
|
ZYZJ05-A039
|
clinical
|
advanced
|
[
"Fusobacterium nucleatum",
"Campylobacter concisus",
"Prevotella intermedia"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 7172
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：1.718
多样性中等，菌群结构相对集中
- Simpson指数：0.77
中等均匀度，存在一定优势菌群
- 物种丰富度：89种
**菌群平衡状态评估：**
菌群状态基本正常，持续监测即可。
**可能原因分析：**
- 抗生素使用史
- 免疫功能低下
- 慢性疾病影响
|
7172
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 6995
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：1.636
多样性中等，菌群结构相对集中
- Simpson指数：0.772
中等均匀度，存在一定优势菌群
- 物种丰富度：21种
**菌群平衡状态评估：**
菌群状态基本正常，持续监测即可。
**可能原因分析：**
- 抗生素使用史
- 免疫功能低下
- 慢性疾病影响
|
6995
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 5002
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：4.897
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.976
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：934种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
5002
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
请分析样本 1061 的微生物检测结果概况。
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样本ID: 1061
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根据样本 1061 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：26,392,805
- 检出物种数：433
- Shannon多样性指数：4.428
- Simpson多样性指数：0.976
**二、优势菌群**
- Faecalibacterium prausnitzii (6.4%)
- Ruminococcus bromii (6.3%)
- Collinsella aerofaciens (5.1%)
- Blautia wexlerae (4.9%)
- Blautia schinkii (4.1%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性良好，微生态状态相对健康。
|
1061
|
overview
|
basic
|
[
"Faecalibacterium prausnitzii (6.4%)",
"Ruminococcus bromii (6.3%)",
"Collinsella aerofaciens (5.1%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
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样本ID: 3181
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：3.07
多样性良好，菌群结构相对平衡
- Simpson指数：0.891
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：431种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
3181
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interpretation
|
intermediate
|
[] |
请分析样本 2559 的微生物检测结果概况。
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样本ID: 2559
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根据样本 2559 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：11,477,011
- 检出物种数：441
- Shannon多样性指数：4.791
- Simpson多样性指数：0.984
**二、优势菌群**
- Coprococcus aceti (6.1%)
- Faecalibacterium prausnitzii (4.9%)
- Dialister invisus (3.2%)
- Alistipes putredinis (3.0%)
- Akkermansia muciniphila (2.6%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性良好，微生态状态相对健康。
|
2559
|
overview
|
basic
|
[
"Coprococcus aceti (6.1%)",
"Faecalibacterium prausnitzii (4.9%)",
"Dialister invisus (3.2%)"
] |
请分析样本 1396 的微生物检测结果概况。
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样本ID: 1396
|
根据样本 1396 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：15,233,131
- 检出物种数：340
- Shannon多样性指数：3.925
- Simpson多样性指数：0.957
**二、优势菌群**
- Bifidobacterium longum (11.4%)
- Faecalicatena fissicatena (8.6%)
- [Ruminococcus] gnavus (8.1%)
- Phocaeicola dorei (6.2%)
- Hominisplanchenecus faecis (6.2%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性良好，微生态状态相对健康。
|
1396
|
overview
|
basic
|
[
"Bifidobacterium longum (11.4%)",
"Faecalicatena fissicatena (8.6%)",
"[Ruminococcus] gnavus (8.1%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: JXEY06D031
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：4.37
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.967
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：1031种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 急性感染状态
|
JXEY06D031
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
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样本ID: 4601
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：4.831
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.971
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：1628种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
4601
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 4397
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：3.179
多样性良好，菌群结构相对平衡
- Simpson指数：0.928
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：336种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
4397
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
检测到 Prevotella intermedia，丰度为 0.10%，请评估其临床意义。
|
样本ID: ZYZJ03-A004
|
Prevotella intermedia（中间普雷沃菌）检测分析：
**1. 病原体特征**
- 检出丰度：0.10%
- 读数：75,879
- 致病类别：oral
- 临床风险等级：low
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低（<1%），可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状，仍需警惕；若无症状，可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 结合临床症状评估
2. 必要时进行药敏试验
3. 动态监测菌量变化
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ZYZJ03-A004
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Prevotella intermedia"
] |
请分析样本 1686 的微生物检测结果概况。
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样本ID: 1686
|
根据样本 1686 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：55,029,506
- 检出物种数：149
- Shannon多样性指数：2.443
- Simpson多样性指数：0.832
**二、优势菌群**
- Bacteroides intestinalis (33.9%)
- Bacteroides cellulosilyticus (17.6%)
- [Clostridium] innocuum (7.8%)
- Bacteroides thetaiotaomicron (7.6%)
- Parabacteroides distasonis (5.9%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性处于正常范围，建议定期监测。
|
1686
|
overview
|
basic
|
[
"Bacteroides intestinalis (33.9%)",
"Bacteroides cellulosilyticus (17.6%)",
"[Clostridium] innocuum (7.8%)"
] |
请分析样本 632 的微生物检测结果概况。
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样本ID: 632
|
根据样本 632 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：289,104,522
- 检出物种数：563
- Shannon多样性指数：4.275
- Simpson多样性指数：0.965
**二、优势菌群**
- Bacteroides stercoris (11.7%)
- Phocaeicola vulgatus (7.9%)
- Bacteroides humanifaecis (7.1%)
- Faecalibacterium prausnitzii (4.7%)
- Phocaeicola dorei (4.0%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性良好，微生态状态相对健康。
|
632
|
overview
|
basic
|
[
"Bacteroides stercoris (11.7%)",
"Phocaeicola vulgatus (7.9%)",
"Bacteroides humanifaecis (7.1%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 2660
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：4.856
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.985
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：469种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
2660
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
检测到 Neisseria meningitidis，丰度为 0.06%，请评估其临床意义。
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样本ID: JXEY04C009
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Neisseria meningitidis（脑膜炎奈瑟菌）检测分析：
**1. 病原体特征**
- 检出丰度：0.06%
- 读数：35,777
- 致病类别：systemic
- 临床风险等级：critical
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低（<1%），可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状，仍需警惕；若无症状，可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 立即进行确认检测
2. 启动感染控制措施
3. 进行药敏试验
4. 考虑会诊感染科
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JXEY04C009
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Neisseria meningitidis"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
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样本ID: 5668
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：2.655
多样性良好，菌群结构相对平衡
- Simpson指数：0.845
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：39种
**菌群平衡状态评估：**
菌群状态基本正常，持续监测即可。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
5668
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
请分析样本 6133 的微生物检测结果概况。
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样本ID: 6133
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根据样本 6133 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：7,222,088
- 检出物种数：107
- Shannon多样性指数：0.294
- Simpson多样性指数：0.077
**二、优势菌群**
- Prochlorococcus marinus (96.0%)
- Eurybiavirus PHM2 (1.1%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性显著降低，可能存在菌群失调，需关注潜在感染风险。
|
6133
|
overview
|
basic
|
[
"Prochlorococcus marinus (96.0%)",
"Eurybiavirus PHM2 (1.1%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 4009
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：3.083
多样性良好，菌群结构相对平衡
- Simpson指数：0.919
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：277种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
4009
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
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样本ID: 651
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菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：3.316
多样性良好，菌群结构相对平衡
- Simpson指数：0.838
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：547种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
651
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
请分析样本 6885 的微生物检测结果概况。
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样本ID: 6885
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根据样本 6885 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：2,263,514
- 检出物种数：50
- Shannon多样性指数：1.888
- Simpson多样性指数：0.818
**二、优势菌群**
- Parvularcula marina (26.6%)
- Nesterenkonia natronophila (20.0%)
- Neospora caninum (19.3%)
- Sus scrofa (16.3%)
- Mesomycoplasma hyorhinis (5.9%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性处于正常范围，建议定期监测。
|
6885
|
overview
|
basic
|
[
"Parvularcula marina (26.6%)",
"Nesterenkonia natronophila (20.0%)",
"Neospora caninum (19.3%)"
] |
请分析样本 2394 的微生物检测结果概况。
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样本ID: 2394
|
根据样本 2394 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：817,845
- 检出物种数：179
- Shannon多样性指数：4.313
- Simpson多样性指数：0.973
**二、优势菌群**
- Streptococcus salivarius (8.8%)
- Streptococcus parasanguinis (8.0%)
- Streptococcus thermophilus (4.4%)
- Anaerotignum lactatifermentans (3.8%)
- Enterococcus faecium (3.8%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性良好，微生态状态相对健康。
|
2394
|
overview
|
basic
|
[
"Streptococcus salivarius (8.8%)",
"Streptococcus parasanguinis (8.0%)",
"Streptococcus thermophilus (4.4%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
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样本ID: 1508
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：3.577
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.942
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：290种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
1508
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 3768
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Bacteroides uniformis (8.9%)
- Shigella dysenteriae (4.7%)
- Phocaeicola vulgatus (4.6%)
- Shigella flexneri (4.6%)
- Escherichia coli (4.5%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为4.291，表明菌群多样性非常高
- 物种丰富度：536个物种
**关键发现：**
- 菌群多样性良好，微生态平衡
|
3768
|
overview
|
basic
|
[
"Bacteroides uniformis (8.9%)",
"Shigella dysenteriae (4.7%)",
"Phocaeicola vulgatus (4.6%)"
] |
请分析样本 7170 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 7170
|
根据样本 7170 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：1,503,078
- 检出物种数：135
- Shannon多样性指数：2.048
- Simpson多样性指数：0.817
**二、优势菌群**
- Neospora caninum (25.5%)
- Parvularcula marina (24.7%)
- Nesterenkonia natronophila (18.0%)
- Sus scrofa (13.1%)
- Alteribacter natronophilus (7.4%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性处于正常范围，建议定期监测。
|
7170
|
overview
|
basic
|
[
"Neospora caninum (25.5%)",
"Parvularcula marina (24.7%)",
"Nesterenkonia natronophila (18.0%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
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样本ID: 70
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：4.271
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.968
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：367种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
70
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
检测到 Fusobacterium nucleatum，丰度为 0.24%，请评估其临床意义。
|
样本ID: JXEY05C009
|
Fusobacterium nucleatum（具核梭杆菌）检测分析：
**1. 病原体特征**
- 检出丰度：0.24%
- 读数：188,512
- 致病类别：oral
- 临床风险等级：medium
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低（<1%），可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状，仍需警惕；若无症状，可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 结合临床症状评估
2. 必要时进行药敏试验
3. 动态监测菌量变化
|
JXEY05C009
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Fusobacterium nucleatum"
] |
请分析样本 4555 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 4555
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根据样本 4555 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：10,389,934
- 检出物种数：2818
- Shannon多样性指数：6.574
- Simpson多样性指数：0.995
**二、优势菌群**
- Acinetobacter johnsonii (4.1%)
- Acidovorax temperans (1.8%)
- Comamonas aquatica (1.5%)
- Zoogloea ramigera (1.4%)
- Aeromonas caviae (1.4%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性良好，微生态状态相对健康。
|
4555
|
overview
|
basic
|
[
"Acinetobacter johnsonii (4.1%)",
"Acidovorax temperans (1.8%)",
"Comamonas aquatica (1.5%)"
] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 3103
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Faecalibacterium prausnitzii (30.3%)
- Faecalibacterium longum (27.6%)
- Lachnospira eligens (5.5%)
- Eisenbergiella massiliensis (3.5%)
- Coprobacillus cateniformis (3.1%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为2.798，表明菌群多样性良好
- 物种丰富度：371个物种
**关键发现：**
- 无特殊发现
|
3103
|
overview
|
basic
|
[
"Faecalibacterium prausnitzii (30.3%)",
"Faecalibacterium longum (27.6%)",
"Lachnospira eligens (5.5%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 302
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：2.012
多样性中等，菌群结构相对集中
- Simpson指数：0.808
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：101种
**菌群平衡状态评估：**
菌群状态基本正常，持续监测即可。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
302
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 168
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Bifidobacterium breve (12.4%)
- Coprococcus phoceensis (8.6%)
- [Clostridium] innocuum (7.9%)
- [Ruminococcus] gnavus (7.7%)
- [Clostridium] nexile (7.3%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为3.931，表明菌群多样性非常高
- 物种丰富度：1212个物种
**关键发现：**
- 菌群多样性良好，微生态平衡
|
168
|
overview
|
basic
|
[
"Bifidobacterium breve (12.4%)",
"Coprococcus phoceensis (8.6%)",
"[Clostridium] innocuum (7.9%)"
] |
请分析样本 5692 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 5692
|
根据样本 5692 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：398,519
- 检出物种数：521
- Shannon多样性指数：5.53
- Simpson多样性指数：0.991
**二、优势菌群**
- Bradyrhizobium erythrophlei (5.0%)
- Pseudarthrobacter albicanus (4.0%)
- Bradyrhizobium lablabi (3.1%)
- Bradyrhizobium sediminis (2.0%)
- Methyloceanibacter superfactus (1.7%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性良好，微生态状态相对健康。
|
5692
|
overview
|
basic
|
[
"Bradyrhizobium erythrophlei (5.0%)",
"Pseudarthrobacter albicanus (4.0%)",
"Bradyrhizobium lablabi (3.1%)"
] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 5509
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Ferribacterium limneticum (9.6%)
- Reyranella aquatilis (4.4%)
- Nitrospira defluvii (3.1%)
- Aquabacterium pictum (1.8%)
- Piscinibacter defluvii (1.7%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为5.37，表明菌群多样性非常高
- 物种丰富度：640个物种
**关键发现：**
- 菌群多样性良好，微生态平衡
|
5509
|
overview
|
basic
|
[
"Ferribacterium limneticum (9.6%)",
"Reyranella aquatilis (4.4%)",
"Nitrospira defluvii (3.1%)"
] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: NTC20250216-5
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Arabidopsis thaliana (23.2%)
- Ehrlichia minasensis (15.2%)
- Nocardioides agariphilus (9.6%)
- Vibrio marinisediminis (6.9%)
- Solihabitans fulvus (3.7%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为2.973，表明菌群多样性良好
- 物种丰富度：186个物种
**关键发现：**
- 无特殊发现
|
NTC20250216-5
|
overview
|
basic
|
[
"Arabidopsis thaliana (23.2%)",
"Ehrlichia minasensis (15.2%)",
"Nocardioides agariphilus (9.6%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 5255
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：5.716
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.992
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：663种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
5255
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: JXEY02C021
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样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Nocardioides agariphilus (3.5%)
- Schaalia odontolytica (3.1%)
- Lysobacter prati (2.9%)
- Prevotella melaninogenica (2.6%)
- Prevotella pallens (2.5%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为5.005，表明菌群多样性非常高
- 物种丰富度：1257个物种
**关键发现：**
- 检出 11 种潜在病原体，需重点关注
- 菌群多样性良好，微生态平衡
|
JXEY02C021
|
overview
|
basic
|
[
"Nocardioides agariphilus (3.5%)",
"Schaalia odontolytica (3.1%)",
"Lysobacter prati (2.9%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 2150
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：3.519
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.94
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：425种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
2150
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 6897
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Parvularcula marina (29.9%)
- Nesterenkonia natronophila (23.2%)
- Neospora caninum (19.6%)
- Sus scrofa (15.0%)
- Alteribacter natronophilus (5.9%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为1.838，表明菌群多样性中等
- 物种丰富度：101个物种
**关键发现：**
- 菌群多样性偏低，可能存在菌群失调
|
6897
|
overview
|
basic
|
[
"Parvularcula marina (29.9%)",
"Nesterenkonia natronophila (23.2%)",
"Neospora caninum (19.6%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 3971
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：2.941
多样性良好，菌群结构相对平衡
- Simpson指数：0.915
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：279种
**菌群平衡状态评估：**
菌群状态基本正常，持续监测即可。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
3971
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 6465
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Parvularcula marina (25.8%)
- Neospora caninum (24.9%)
- Nesterenkonia natronophila (19.3%)
- Sus scrofa (17.2%)
- Alteribacter natronophilus (5.6%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为1.802，表明菌群多样性中等
- 物种丰富度：32个物种
**关键发现：**
- 菌群多样性偏低，可能存在菌群失调
|
6465
|
overview
|
basic
|
[
"Parvularcula marina (25.8%)",
"Neospora caninum (24.9%)",
"Nesterenkonia natronophila (19.3%)"
] |
请分析样本 5212 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 5212
|
根据样本 5212 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：752,744
- 检出物种数：456
- Shannon多样性指数：5.506
- Simpson多样性指数：0.993
**二、优势菌群**
- Skermania piniformis (2.9%)
- Phycicoccus elongatus (2.7%)
- Piscinibacter defluvii (1.9%)
- Tetrasphaera jenkinsii (1.7%)
- Sphingorhabdus pulchriflava (1.5%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性良好，微生态状态相对健康。
|
5212
|
overview
|
basic
|
[
"Skermania piniformis (2.9%)",
"Phycicoccus elongatus (2.7%)",
"Piscinibacter defluvii (1.9%)"
] |
针对此微生物检测结果，应该采取什么治疗策略？
|
样本ID: ZYQC05-A050
|
治疗策略建议：
**一、主要关注病原体**
- Fusobacterium nucleatum（具核梭杆菌）- 风险等级：medium
- Neisseria meningitidis（脑膜炎奈瑟菌）- 风险等级：critical
- Campylobacter concisus（简明弯曲杆菌）- 风险等级：low
**二、经验性抗菌治疗建议**
- 检出革兰阳性和革兰阴性菌，建议广谱抗菌治疗
- 可选：哌拉西林/他唑巴坦、头孢哌酮/舒巴坦或碳青霉烯类
**三、进一步检查建议**
- 药敏试验指导精准用药
- 炎症指标监测（CRP、PCT）
- 必要时重复微生物检测评估疗效
**四、治疗监测要点**
- 48-72小时评估临床反应
- 根据药敏结果降阶梯治疗
- 注意药物不良反应监测
**注意：** 治疗方案需结合患者临床症状、既往用药史及当地耐药流行病学数据综合制定。
|
ZYQC05-A050
|
clinical
|
advanced
|
[
"Fusobacterium nucleatum",
"Neisseria meningitidis",
"Campylobacter concisus"
] |
请分析样本 4769 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 4769
|
根据样本 4769 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：1,032,978
- 检出物种数：1041
- Shannon多样性指数：5.97
- Simpson多样性指数：0.992
**二、优势菌群**
- Micrococcus aloeverae (4.4%)
- Micrococcus yunnanensis (4.4%)
- Micrococcus luteus (3.3%)
- Cutibacterium acnes (3.0%)
- Kocuria rhizophila (1.6%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性良好，微生态状态相对健康。
|
4769
|
overview
|
basic
|
[
"Micrococcus aloeverae (4.4%)",
"Micrococcus yunnanensis (4.4%)",
"Micrococcus luteus (3.3%)"
] |
针对此微生物检测结果，应该采取什么治疗策略？
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样本ID: PTC20250220-2
|
治疗策略建议：
**一、主要关注病原体**
- Staphylococcus aureus（金黄色葡萄球菌）- 风险等级：high
**二、经验性抗菌治疗建议**
- 以革兰阳性菌为主，首选：万古霉素或利奈唑胺（疑似MRSA时）
- 非耐药菌可选：苯唑西林或头孢唑林
**三、进一步检查建议**
- 药敏试验指导精准用药
- 炎症指标监测（CRP、PCT）
- 必要时重复微生物检测评估疗效
**四、治疗监测要点**
- 48-72小时评估临床反应
- 根据药敏结果降阶梯治疗
- 注意药物不良反应监测
**注意：** 治疗方案需结合患者临床症状、既往用药史及当地耐药流行病学数据综合制定。
|
PTC20250220-2
|
clinical
|
advanced
|
[
"Staphylococcus aureus"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 7644
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：3.578
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.916
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：245种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
7644
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
请分析样本 2157 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 2157
|
根据样本 2157 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：17,976,136
- 检出物种数：381
- Shannon多样性指数：3.54
- Simpson多样性指数：0.911
**二、优势菌群**
- Prevotella copri (20.6%)
- Prevotella hominis (16.1%)
- Prevotellamassilia timonensis (11.9%)
- Prevotella stercorea (4.0%)
- Faecalibacterium prausnitzii (3.9%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性良好，微生态状态相对健康。
|
2157
|
overview
|
basic
|
[
"Prevotella copri (20.6%)",
"Prevotella hominis (16.1%)",
"Prevotellamassilia timonensis (11.9%)"
] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 7064
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Parvularcula marina (25.1%)
- Neospora caninum (24.6%)
- Nesterenkonia natronophila (19.8%)
- Sus scrofa (11.4%)
- Mesomycoplasma hyopneumoniae (8.4%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为1.857，表明菌群多样性中等
- 物种丰富度：47个物种
**关键发现：**
- 菌群多样性偏低，可能存在菌群失调
|
7064
|
overview
|
basic
|
[
"Parvularcula marina (25.1%)",
"Neospora caninum (24.6%)",
"Nesterenkonia natronophila (19.8%)"
] |
针对此微生物检测结果，应该采取什么治疗策略？
|
样本ID: ZYQC02-A054
|
治疗策略建议：
**一、主要关注病原体**
- Campylobacter concisus（简明弯曲杆菌）- 风险等级：low
- Fusobacterium nucleatum（具核梭杆菌）- 风险等级：medium
- Neisseria meningitidis（脑膜炎奈瑟菌）- 风险等级：critical
**二、经验性抗菌治疗建议**
- 以革兰阴性菌为主，首选：三代或四代头孢菌素
- 重症或耐药风险高时：碳青霉烯类
**三、进一步检查建议**
- 药敏试验指导精准用药
- 炎症指标监测（CRP、PCT）
- 必要时重复微生物检测评估疗效
**四、治疗监测要点**
- 48-72小时评估临床反应
- 根据药敏结果降阶梯治疗
- 注意药物不良反应监测
**注意：** 治疗方案需结合患者临床症状、既往用药史及当地耐药流行病学数据综合制定。
|
ZYQC02-A054
|
clinical
|
advanced
|
[
"Campylobacter concisus",
"Fusobacterium nucleatum",
"Neisseria meningitidis"
] |
检测到 Streptococcus pneumoniae，丰度为 0.24%，请评估其临床意义。
|
样本ID: ZYQC05-A011
|
Streptococcus pneumoniae（肺炎链球菌）检测分析：
**1. 病原体特征**
- 检出丰度：0.24%
- 读数：201,443
- 致病类别：respiratory
- 临床风险等级：high
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低（<1%），可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状，仍需警惕；若无症状，可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 进行药敏试验指导用药
2. 根据感染部位选择合适抗菌方案
3. 密切监测治疗效果
|
ZYQC05-A011
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Streptococcus pneumoniae"
] |
检测到 Fusobacterium nucleatum，丰度为 1.46%，请评估其临床意义。
|
样本ID: ZYQC06-A021
|
Fusobacterium nucleatum（具核梭杆菌）检测分析：
**1. 病原体特征**
- 检出丰度：1.46%
- 读数：904,660
- 致病类别：oral
- 临床风险等级：medium
**2. 临床意义评估**
该菌丰度中等（1.5%），可能为致病原因或定植状态。需结合临床症状判断是否为病因。
**3. 建议措施**
1. 结合临床症状评估
2. 必要时进行药敏试验
3. 动态监测菌量变化
|
ZYQC06-A021
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Fusobacterium nucleatum"
] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 6808
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Parvularcula marina (30.8%)
- Nesterenkonia natronophila (22.6%)
- Neospora caninum (20.4%)
- Sus scrofa (11.9%)
- Alteribacter natronophilus (6.3%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为1.905，表明菌群多样性中等
- 物种丰富度：88个物种
**关键发现：**
- 菌群多样性偏低，可能存在菌群失调
|
6808
|
overview
|
basic
|
[
"Parvularcula marina (30.8%)",
"Nesterenkonia natronophila (22.6%)",
"Neospora caninum (20.4%)"
] |
检测到 Streptococcus pneumoniae，丰度为 0.78%，请评估其临床意义。
|
样本ID: JXEY02B002
|
Streptococcus pneumoniae（肺炎链球菌）检测分析：
**1. 病原体特征**
- 检出丰度：0.78%
- 读数：499,167
- 致病类别：respiratory
- 临床风险等级：high
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低（<1%），可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状，仍需警惕；若无症状，可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 进行药敏试验指导用药
2. 根据感染部位选择合适抗菌方案
3. 密切监测治疗效果
|
JXEY02B002
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Streptococcus pneumoniae"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: ZYQC06-A016
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：4.839
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.983
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：1501种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 急性感染状态
|
ZYQC06-A016
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
检测到 Streptococcus pneumoniae，丰度为 0.20%，请评估其临床意义。
|
样本ID: JXEY07E025
|
Streptococcus pneumoniae（肺炎链球菌）检测分析：
**1. 病原体特征**
- 检出丰度：0.20%
- 读数：144,776
- 致病类别：respiratory
- 临床风险等级：high
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低（<1%），可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状，仍需警惕；若无症状，可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 进行药敏试验指导用药
2. 根据感染部位选择合适抗菌方案
3. 密切监测治疗效果
|
JXEY07E025
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Streptococcus pneumoniae"
] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 2806
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Bacteroides koreensis (15.1%)
- Bacteroides kribbi (15.1%)
- Bacteroides ovatus (14.6%)
- Bacteroides xylanisolvens (10.9%)
- Bacteroides thetaiotaomicron (8.5%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为3.162，表明菌群多样性良好
- 物种丰富度：439个物种
**关键发现：**
- 菌群多样性良好，微生态平衡
|
2806
|
overview
|
basic
|
[
"Bacteroides koreensis (15.1%)",
"Bacteroides kribbi (15.1%)",
"Bacteroides ovatus (14.6%)"
] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 6144
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Alteromonas australica (18.7%)
- Alteromonas macleodii (15.1%)
- Vibrio campbellii (8.9%)
- Alteromonas marina (5.1%)
- Alloalcanivorax venustensis (4.7%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为3.475，表明菌群多样性良好
- 物种丰富度：144个物种
**关键发现：**
- 菌群多样性良好，微生态平衡
|
6144
|
overview
|
basic
|
[
"Alteromonas australica (18.7%)",
"Alteromonas macleodii (15.1%)",
"Vibrio campbellii (8.9%)"
] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 165
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Bifidobacterium breve (14.4%)
- Bifidobacterium longum (12.5%)
- Bifidobacterium scardovii (8.6%)
- Prevotella copri (7.4%)
- Veillonella parvula (6.7%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为3.369，表明菌群多样性良好
- 物种丰富度：1105个物种
**关键发现：**
- 菌群多样性良好，微生态平衡
|
165
|
overview
|
basic
|
[
"Bifidobacterium breve (14.4%)",
"Bifidobacterium longum (12.5%)",
"Bifidobacterium scardovii (8.6%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 1338
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：1.775
多样性中等，菌群结构相对集中
- Simpson指数：0.808
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：8种
**菌群平衡状态评估：**
菌群状态基本正常，持续监测即可。
**可能原因分析：**
- 抗生素使用史
- 免疫功能低下
- 慢性疾病影响
|
1338
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: JXEY04C022
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：5.181
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.986
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：1439种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 急性感染状态
|
JXEY04C022
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 2922
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Phocaeicola vulgatus (14.7%)
- Bacteroides uniformis (13.0%)
- Alistipes putredinis (6.9%)
- Bacteroides caccae (6.3%)
- Bacteroides humanifaecis (5.0%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为3.508，表明菌群多样性非常高
- 物种丰富度：344个物种
**关键发现：**
- 菌群多样性良好，微生态平衡
|
2922
|
overview
|
basic
|
[
"Phocaeicola vulgatus (14.7%)",
"Bacteroides uniformis (13.0%)",
"Alistipes putredinis (6.9%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 4282
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：4.426
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.942
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：498种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
4282
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
检测到 Streptococcus pneumoniae，丰度为 0.20%，请评估其临床意义。
|
样本ID: ZYYH06-A011
|
Streptococcus pneumoniae（肺炎链球菌）检测分析：
**1. 病原体特征**
- 检出丰度：0.20%
- 读数：91,214
- 致病类别：respiratory
- 临床风险等级：high
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低（<1%），可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状，仍需警惕；若无症状，可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 进行药敏试验指导用药
2. 根据感染部位选择合适抗菌方案
3. 密切监测治疗效果
|
ZYYH06-A011
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Streptococcus pneumoniae"
] |
检测到 Campylobacter concisus，丰度为 1.24%，请评估其临床意义。
|
样本ID: JXEY05A026
|
Campylobacter concisus（简明弯曲杆菌）检测分析：
**1. 病原体特征**
- 检出丰度：1.24%
- 读数：686,724
- 致病类别：oral
- 临床风险等级：low
**2. 临床意义评估**
该菌丰度中等（1.2%），可能为致病原因或定植状态。需结合临床症状判断是否为病因。
**3. 建议措施**
1. 结合临床症状评估
2. 必要时进行药敏试验
3. 动态监测菌量变化
|
JXEY05A026
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Campylobacter concisus"
] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 5078
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Dechloromonas agitata (7.1%)
- Desulfomicrobium escambiense (3.3%)
- Desulfovibrio desulfuricans (2.5%)
- Acidovorax temperans (2.3%)
- Parabacteroides chartae (2.2%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为5.83，表明菌群多样性非常高
- 物种丰富度：1448个物种
**关键发现：**
- 菌群多样性良好，微生态平衡
|
5078
|
overview
|
basic
|
[
"Dechloromonas agitata (7.1%)",
"Desulfomicrobium escambiense (3.3%)",
"Desulfovibrio desulfuricans (2.5%)"
] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 4880
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Micrococcus yunnanensis (7.6%)
- Micrococcus aloeverae (7.4%)
- Micrococcus luteus (5.6%)
- Moraxella osloensis (4.2%)
- Paracoccus salipaludis (3.7%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为5.132，表明菌群多样性非常高
- 物种丰富度：988个物种
**关键发现：**
- 菌群多样性良好，微生态平衡
|
4880
|
overview
|
basic
|
[
"Micrococcus yunnanensis (7.6%)",
"Micrococcus aloeverae (7.4%)",
"Micrococcus luteus (5.6%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 2244
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：3.552
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.882
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：350种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
2244
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 1551
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：2.166
多样性中等，菌群结构相对集中
- Simpson指数：0.798
中等均匀度，存在一定优势菌群
- 物种丰富度：74种
**菌群平衡状态评估：**
菌群状态基本正常，持续监测即可。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
1551
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
请分析样本 1436 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 1436
|
根据样本 1436 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：5,357,745
- 检出物种数：249
- Shannon多样性指数：3.169
- Simpson多样性指数：0.883
**二、优势菌群**
- Parabacteroides merdae (26.1%)
- Parabacteroides distasonis (17.6%)
- Alistipes onderdonkii (10.9%)
- Parabacteroides johnsonii (3.7%)
- Enterocloster bolteae (3.2%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性良好，微生态状态相对健康。
|
1436
|
overview
|
basic
|
[
"Parabacteroides merdae (26.1%)",
"Parabacteroides distasonis (17.6%)",
"Alistipes onderdonkii (10.9%)"
] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 2373
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Faecalibacterium prausnitzii (19.8%)
- Bacteroides fragilis (13.8%)
- Oscillibacter valericigenes (3.1%)
- Gemmiger formicilis (2.5%)
- Akkermansia muciniphila (2.4%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为4.058，表明菌群多样性非常高
- 物种丰富度：262个物种
**关键发现：**
- 菌群多样性良好，微生态平衡
|
2373
|
overview
|
basic
|
[
"Faecalibacterium prausnitzii (19.8%)",
"Bacteroides fragilis (13.8%)",
"Oscillibacter valericigenes (3.1%)"
] |
请分析样本 18 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 18
|
根据样本 18 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：37,074,369
- 检出物种数：423
- Shannon多样性指数：3.992
- Simpson多样性指数：0.959
**二、优势菌群**
- Roseburia faecis (11.8%)
- Phocaeicola vulgatus (10.5%)
- Bacteroides ovatus (4.8%)
- Bacteroides uniformis (4.2%)
- Faecalibacterium prausnitzii (4.2%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性良好，微生态状态相对健康。
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18
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overview
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basic
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[
"Roseburia faecis (11.8%)",
"Phocaeicola vulgatus (10.5%)",
"Bacteroides ovatus (4.8%)"
] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
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样本ID: 2029
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样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Pan troglodytes (14.4%)
- Prevotella histicola (6.9%)
- Prevotella jejuni (5.5%)
- Neisseria mucosa (4.4%)
- Chlorocebus aethiops (3.8%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为3.869，表明菌群多样性非常高
- 物种丰富度：269个物种
**关键发现：**
- 菌群多样性良好，微生态平衡
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2029
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overview
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basic
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[
"Pan troglodytes (14.4%)",
"Prevotella histicola (6.9%)",
"Prevotella jejuni (5.5%)"
] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
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样本ID: 5397
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样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Marinobacter manganoxydans (34.8%)
- Marinobacter flavimaris (28.5%)
- Marinobacter adhaerens (17.0%)
- Marinobacter maroccanus (2.3%)
- Marinobacter salsuginis (1.3%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为2.474，表明菌群多样性中等
- 物种丰富度：1262个物种
**关键发现：**
- 无特殊发现
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5397
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overview
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basic
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[
"Marinobacter manganoxydans (34.8%)",
"Marinobacter flavimaris (28.5%)",
"Marinobacter adhaerens (17.0%)"
] |
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