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stringlengths 19
61
| input
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34
| output
stringlengths 132
823
| sample_id
stringlengths 1
28
| question_type
stringclasses 4
values | difficulty
stringclasses 3
values | species_involved
listlengths 0
3
|
|---|---|---|---|---|---|---|
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 5194
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Acidovorax temperans (9.3%)
- Uruburuella suis (6.8%)
- Aliarcobacter cryaerophilus (2.6%)
- Comamonas denitrificans (2.3%)
- Faecalibacterium prausnitzii (2.1%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为5.044，表明菌群多样性非常高
- 物种丰富度：488个物种
**关键发现：**
- 菌群多样性良好，微生态平衡
|
5194
|
overview
|
basic
|
[
"Acidovorax temperans (9.3%)",
"Uruburuella suis (6.8%)",
"Aliarcobacter cryaerophilus (2.6%)"
] |
请分析样本 145 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 145
|
根据样本 145 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：1,467,381
- 检出物种数：389
- Shannon多样性指数：2.564
- Simpson多样性指数：0.878
**二、优势菌群**
- Actinomyces ihuae (21.8%)
- Schaalia radingae (19.5%)
- Klebsiella oxytoca (9.9%)
- Clostridioides difficile (9.1%)
- Bifidobacterium dentium (8.5%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性处于正常范围，建议定期监测。
|
145
|
overview
|
basic
|
[
"Actinomyces ihuae (21.8%)",
"Schaalia radingae (19.5%)",
"Klebsiella oxytoca (9.9%)"
] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 4683
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Cutibacterium acnes (5.5%)
- Micrococcus yunnanensis (1.6%)
- Micrococcus aloeverae (1.6%)
- Micrococcus luteus (1.3%)
- Corynebacterium tuberculostearicum (1.3%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为6.297，表明菌群多样性非常高
- 物种丰富度：1329个物种
**关键发现：**
- 菌群多样性良好，微生态平衡
- 优势菌含潜在致病属（Cutibacterium），需警惕
|
4683
|
overview
|
basic
|
[
"Cutibacterium acnes (5.5%)",
"Micrococcus yunnanensis (1.6%)",
"Micrococcus aloeverae (1.6%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 5792
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：4.78
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.943
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：833种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
5792
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 5353
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：5.834
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.994
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：643种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
5353
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 3891
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：3.425
多样性良好，菌群结构相对平衡
- Simpson指数：0.904
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：365种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
3891
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
检测到 Neisseria meningitidis，丰度为 0.28%，请评估其临床意义。
|
样本ID: LJDX-03-A003
|
Neisseria meningitidis（脑膜炎奈瑟菌）检测分析：
**1. 病原体特征**
- 检出丰度：0.28%
- 读数：28,438
- 致病类别：systemic
- 临床风险等级：critical
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低（<1%），可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状，仍需警惕；若无症状，可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 立即进行确认检测
2. 启动感染控制措施
3. 进行药敏试验
4. 考虑会诊感染科
|
LJDX-03-A003
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Neisseria meningitidis"
] |
检测到 Fusobacterium nucleatum，丰度为 0.10%，请评估其临床意义。
|
样本ID: ZYQC02-A004
|
Fusobacterium nucleatum（具核梭杆菌）检测分析：
**1. 病原体特征**
- 检出丰度：0.10%
- 读数：60,373
- 致病类别：oral
- 临床风险等级：medium
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低（<1%），可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状，仍需警惕；若无症状，可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 结合临床症状评估
2. 必要时进行药敏试验
3. 动态监测菌量变化
|
ZYQC02-A004
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Fusobacterium nucleatum"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 4902
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：5.339
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.992
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：377种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
4902
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 7267
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Anas platyrhynchos (27.8%)
- Mesorhizobium silamurunense (19.7%)
- Elizabethkingia argenteiflava (9.2%)
- Cobetia crustatorum (7.6%)
- Anser cygnoides (7.0%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为2.294，表明菌群多样性中等
- 物种丰富度：67个物种
**关键发现：**
- 无特殊发现
|
7267
|
overview
|
basic
|
[
"Anas platyrhynchos (27.8%)",
"Mesorhizobium silamurunense (19.7%)",
"Elizabethkingia argenteiflava (9.2%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 6720
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：1.91
多样性中等，菌群结构相对集中
- Simpson指数：0.8
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：94种
**菌群平衡状态评估：**
菌群状态基本正常，持续监测即可。
**可能原因分析：**
- 抗生素使用史
- 免疫功能低下
- 慢性疾病影响
|
6720
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: JXEY02H002
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：5.172
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.989
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：1461种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 急性感染状态
|
JXEY02H002
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
检测到 Streptococcus pneumoniae，丰度为 2.02%，请评估其临床意义。
|
样本ID: JXEY02C019
|
Streptococcus pneumoniae（肺炎链球菌）检测分析：
**1. 病原体特征**
- 检出丰度：2.02%
- 读数：1,398,726
- 致病类别：respiratory
- 临床风险等级：high
**2. 临床意义评估**
该菌丰度中等（2.0%），可能为致病原因或定植状态。需结合临床症状判断是否为病因。
**3. 建议措施**
1. 进行药敏试验指导用药
2. 根据感染部位选择合适抗菌方案
3. 密切监测治疗效果
|
JXEY02C019
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Streptococcus pneumoniae"
] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 1870
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Faecalibacterium prausnitzii (18.0%)
- Faecalibacterium longum (13.4%)
- Roseburia faecis (8.7%)
- Anaerostipes hadrus (8.0%)
- Phocaeicola plebeius (3.5%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为3.718，表明菌群多样性非常高
- 物种丰富度：412个物种
**关键发现：**
- 菌群多样性良好，微生态平衡
|
1870
|
overview
|
basic
|
[
"Faecalibacterium prausnitzii (18.0%)",
"Faecalibacterium longum (13.4%)",
"Roseburia faecis (8.7%)"
] |
检测到 Fusobacterium nucleatum，丰度为 0.27%，请评估其临床意义。
|
样本ID: ZYYH06-A010
|
Fusobacterium nucleatum（具核梭杆菌）检测分析：
**1. 病原体特征**
- 检出丰度：0.27%
- 读数：144,057
- 致病类别：oral
- 临床风险等级：medium
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低（<1%），可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状，仍需警惕；若无症状，可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 结合临床症状评估
2. 必要时进行药敏试验
3. 动态监测菌量变化
|
ZYYH06-A010
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Fusobacterium nucleatum"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 7698
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：2.277
多样性中等，菌群结构相对集中
- Simpson指数：0.754
中等均匀度，存在一定优势菌群
- 物种丰富度：139种
**菌群平衡状态评估：**
菌群状态基本正常，持续监测即可。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
7698
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: ZYQC03-A012
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Streptococcus mitis (6.6%)
- Streptococcus oralis (6.3%)
- Schaalia odontolytica (3.3%)
- Neisseria subflava (3.3%)
- Prevotella melaninogenica (2.3%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为4.968，表明菌群多样性非常高
- 物种丰富度：1325个物种
**关键发现：**
- 检出 11 种潜在病原体，需重点关注
- 菌群多样性良好，微生态平衡
- 优势菌为常驻菌群（Streptococcus属），总体正常
|
ZYQC03-A012
|
overview
|
basic
|
[
"Streptococcus mitis (6.6%)",
"Streptococcus oralis (6.3%)",
"Schaalia odontolytica (3.3%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 5941
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：4.859
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.99
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：195种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
5941
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 6126
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Vibrio campbellii (49.2%)
- Prochlorococcus marinus (7.6%)
- Vibrio owensii (7.3%)
- Vibrio chagasii (6.1%)
- Vibrio harveyi (4.2%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为2.26，表明菌群多样性中等
- 物种丰富度：294个物种
**关键发现：**
- 优势菌含潜在致病属（Vibrio），需警惕
|
6126
|
overview
|
basic
|
[
"Vibrio campbellii (49.2%)",
"Prochlorococcus marinus (7.6%)",
"Vibrio owensii (7.3%)"
] |
请分析样本 7484 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 7484
|
根据样本 7484 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：5,197,772
- 检出物种数：271
- Shannon多样性指数：3.639
- Simpson多样性指数：0.92
**二、优势菌群**
- Parabacteroides goldsteinii (22.5%)
- Bacteroides thetaiotaomicron (13.9%)
- Bacteroides xylanisolvens (5.1%)
- Anas platyrhynchos (4.3%)
- Bacteroides ovatus (2.9%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性良好，微生态状态相对健康。
|
7484
|
overview
|
basic
|
[
"Parabacteroides goldsteinii (22.5%)",
"Bacteroides thetaiotaomicron (13.9%)",
"Bacteroides xylanisolvens (5.1%)"
] |
请分析样本 7434 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 7434
|
根据样本 7434 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：18,417,903
- 检出物种数：516
- Shannon多样性指数：3.682
- Simpson多样性指数：0.923
**二、优势菌群**
- Bacteroides caecigallinarum (23.1%)
- Phocaeicola barnesiae (8.8%)
- Bacteroides cellulolyticus (7.3%)
- Phocaeicola plebeius (5.3%)
- Megamonas funiformis (4.4%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性良好，微生态状态相对健康。
|
7434
|
overview
|
basic
|
[
"Bacteroides caecigallinarum (23.1%)",
"Phocaeicola barnesiae (8.8%)",
"Bacteroides cellulolyticus (7.3%)"
] |
请分析样本 2149 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 2149
|
根据样本 2149 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：20,359,759
- 检出物种数：386
- Shannon多样性指数：3.309
- Simpson多样性指数：0.911
**二、优势菌群**
- Human mastadenovirus F (20.4%)
- Prevotella copri (12.2%)
- Prevotella hominis (12.0%)
- Bifidobacterium catenulatum (9.5%)
- Bifidobacterium bifidum (4.9%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性良好，微生态状态相对健康。
|
2149
|
overview
|
basic
|
[
"Human mastadenovirus F (20.4%)",
"Prevotella copri (12.2%)",
"Prevotella hominis (12.0%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: JXEY01D012
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：4.298
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.964
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：1009种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 急性感染状态
|
JXEY01D012
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
检测到 Porphyromonas gingivalis，丰度为 0.34%，请评估其临床意义。
|
样本ID: ZYQC02-A041
|
Porphyromonas gingivalis（牙龈卟啉单胞菌）检测分析：
**1. 病原体特征**
- 检出丰度：0.34%
- 读数：120,651
- 致病类别：oral
- 临床风险等级：medium
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低（<1%），可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状，仍需警惕；若无症状，可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 结合临床症状评估
2. 必要时进行药敏试验
3. 动态监测菌量变化
|
ZYQC02-A041
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Porphyromonas gingivalis"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 161
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：2.008
多样性中等，菌群结构相对集中
- Simpson指数：0.718
中等均匀度，存在一定优势菌群
- 物种丰富度：587种
**菌群平衡状态评估：**
菌群状态基本正常，持续监测即可。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
161
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
请分析样本 6969 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 6969
|
根据样本 6969 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：2,083,531
- 检出物种数：95
- Shannon多样性指数：2.094
- Simpson多样性指数：0.829
**二、优势菌群**
- Neospora caninum (23.2%)
- Parvularcula marina (23.1%)
- Nesterenkonia natronophila (18.7%)
- Sus scrofa (15.2%)
- Alteribacter natronophilus (6.1%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性处于正常范围，建议定期监测。
|
6969
|
overview
|
basic
|
[
"Neospora caninum (23.2%)",
"Parvularcula marina (23.1%)",
"Nesterenkonia natronophila (18.7%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 3652
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：4.792
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.983
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：472种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
3652
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 2306
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Prevotella copri (43.2%)
- Prevotella hominis (26.8%)
- Faecalibacterium prausnitzii (6.9%)
- Brotolimicola acetigignens (3.7%)
- Prevotellamassilia timonensis (1.3%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为2.168，表明菌群多样性中等
- 物种丰富度：170个物种
**关键发现：**
- 优势菌为常驻菌群（Prevotella属），总体正常
|
2306
|
overview
|
basic
|
[
"Prevotella copri (43.2%)",
"Prevotella hominis (26.8%)",
"Faecalibacterium prausnitzii (6.9%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 5609
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：5.252
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.989
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：381种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
5609
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
请分析样本 7271 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 7271
|
根据样本 7271 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：6,204,904
- 检出物种数：355
- Shannon多样性指数：3.806
- Simpson多样性指数：0.938
**二、优势菌群**
- Anas platyrhynchos (20.0%)
- Cobetia crustatorum (8.7%)
- Anser cygnoides (5.0%)
- Bacteroides caecigallinarum (4.9%)
- Cygnus atratus (3.5%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性良好，微生态状态相对健康。
|
7271
|
overview
|
basic
|
[
"Anas platyrhynchos (20.0%)",
"Cobetia crustatorum (8.7%)",
"Anser cygnoides (5.0%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 6427
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：2.091
多样性中等，菌群结构相对集中
- Simpson指数：0.778
中等均匀度，存在一定优势菌群
- 物种丰富度：97种
**菌群平衡状态评估：**
菌群状态基本正常，持续监测即可。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
6427
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: JXEY07D028
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Streptococcus mitis (6.6%)
- Streptococcus oralis (6.0%)
- Prevotella melaninogenica (4.1%)
- Neisseria subflava (3.1%)
- Gemella haemolysans (2.8%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为5.032，表明菌群多样性非常高
- 物种丰富度：1547个物种
**关键发现：**
- 检出 14 种潜在病原体，需重点关注
- 菌群多样性良好，微生态平衡
- 优势菌为常驻菌群（Streptococcus属），总体正常
|
JXEY07D028
|
overview
|
basic
|
[
"Streptococcus mitis (6.6%)",
"Streptococcus oralis (6.0%)",
"Prevotella melaninogenica (4.1%)"
] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 678
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Phocaeicola dorei (14.6%)
- Phocaeicola vulgatus (11.0%)
- Bacteroides stercoris (6.0%)
- Bacteroides uniformis (4.9%)
- Faecalibacterium prausnitzii (3.6%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为3.966，表明菌群多样性非常高
- 物种丰富度：460个物种
**关键发现：**
- 菌群多样性良好，微生态平衡
|
678
|
overview
|
basic
|
[
"Phocaeicola dorei (14.6%)",
"Phocaeicola vulgatus (11.0%)",
"Bacteroides stercoris (6.0%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 4444
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：4.632
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.959
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：400种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
4444
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
检测到 Neisseria meningitidis，丰度为 0.26%，请评估其临床意义。
|
样本ID: JXEY07E044
|
Neisseria meningitidis（脑膜炎奈瑟菌）检测分析：
**1. 病原体特征**
- 检出丰度：0.26%
- 读数：212,691
- 致病类别：systemic
- 临床风险等级：critical
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低（<1%），可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状，仍需警惕；若无症状，可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 立即进行确认检测
2. 启动感染控制措施
3. 进行药敏试验
4. 考虑会诊感染科
|
JXEY07E044
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Neisseria meningitidis"
] |
针对此微生物检测结果，应该采取什么治疗策略？
|
样本ID: ZYQC03-A005
|
治疗策略建议：
**一、主要关注病原体**
- Fusobacterium nucleatum（具核梭杆菌）- 风险等级：medium
- Campylobacter concisus（简明弯曲杆菌）- 风险等级：low
- Streptococcus pneumoniae（肺炎链球菌）- 风险等级：high
**二、经验性抗菌治疗建议**
- 以革兰阳性菌为主，首选：万古霉素或利奈唑胺（疑似MRSA时）
- 非耐药菌可选：苯唑西林或头孢唑林
**三、进一步检查建议**
- 药敏试验指导精准用药
- 炎症指标监测（CRP、PCT）
- 必要时重复微生物检测评估疗效
**四、治疗监测要点**
- 48-72小时评估临床反应
- 根据药敏结果降阶梯治疗
- 注意药物不良反应监测
**注意：** 治疗方案需结合患者临床症状、既往用药史及当地耐药流行病学数据综合制定。
|
ZYQC03-A005
|
clinical
|
advanced
|
[
"Fusobacterium nucleatum",
"Campylobacter concisus",
"Streptococcus pneumoniae"
] |
请分析样本 5674 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 5674
|
根据样本 5674 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：176,975
- 检出物种数：160
- Shannon多样性指数：4.718
- Simpson多样性指数：0.988
**二、优势菌群**
- Pengzhenrongella sicca (3.6%)
- Hyphomicrobium album (3.1%)
- Bradyrhizobium liaoningense (2.5%)
- Cellulomonas hominis (2.4%)
- Pseudonocardia alaniniphila (2.4%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性良好，微生态状态相对健康。
|
5674
|
overview
|
basic
|
[
"Pengzhenrongella sicca (3.6%)",
"Hyphomicrobium album (3.1%)",
"Bradyrhizobium liaoningense (2.5%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 3031
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：3.922
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.943
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：468种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
3031
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 5657
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：4.389
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.957
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：215种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
5657
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 7615
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Succiniclasticum ruminis (17.4%)
- Methanobrevibacter thaueri (7.6%)
- Prevotella ruminicola (7.5%)
- Prevotella aff. ruminicola Tc2-24 (5.2%)
- Methanobrevibacter millerae (4.4%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为3.902，表明菌群多样性非常高
- 物种丰富度：241个物种
**关键发现：**
- 菌群多样性良好，微生态平衡
|
7615
|
overview
|
basic
|
[
"Succiniclasticum ruminis (17.4%)",
"Methanobrevibacter thaueri (7.6%)",
"Prevotella ruminicola (7.5%)"
] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 6376
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Gilliamella apicola (21.2%)
- Apis mellifera (9.9%)
- Lactobacillus melliventris (9.1%)
- Lactobacillus helsingborgensis (9.0%)
- Lactobacillus apis (5.4%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为2.917，表明菌群多样性良好
- 物种丰富度：75个物种
**关键发现：**
- 无特殊发现
|
6376
|
overview
|
basic
|
[
"Gilliamella apicola (21.2%)",
"Apis mellifera (9.9%)",
"Lactobacillus melliventris (9.1%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 5749
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：3.73
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.968
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：60种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
5749
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 3578
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：4.37
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.953
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：501种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
3578
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
检测到 Fusobacterium nucleatum，丰度为 0.22%，请评估其临床意义。
|
样本ID: ZYZJ05-H002
|
Fusobacterium nucleatum（具核梭杆菌）检测分析：
**1. 病原体特征**
- 检出丰度：0.22%
- 读数：98,253
- 致病类别：oral
- 临床风险等级：medium
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低（<1%），可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状，仍需警惕；若无症状，可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 结合临床症状评估
2. 必要时进行药敏试验
3. 动态监测菌量变化
|
ZYZJ05-H002
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Fusobacterium nucleatum"
] |
检测到 Streptococcus pneumoniae，丰度为 1.16%，请评估其临床意义。
|
样本ID: ZYQC01-A010
|
Streptococcus pneumoniae（肺炎链球菌）检测分析：
**1. 病原体特征**
- 检出丰度：1.16%
- 读数：402,363
- 致病类别：respiratory
- 临床风险等级：high
**2. 临床意义评估**
该菌丰度中等（1.2%），可能为致病原因或定植状态。需结合临床症状判断是否为病因。
**3. 建议措施**
1. 进行药敏试验指导用药
2. 根据感染部位选择合适抗菌方案
3. 密切监测治疗效果
|
ZYQC01-A010
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Streptococcus pneumoniae"
] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: JXEY07A002
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Prevotella melaninogenica (5.7%)
- Streptococcus salivarius (4.4%)
- Veillonella dispar (4.3%)
- Veillonella nakazawae (3.9%)
- Veillonella atypica (3.7%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为4.738，表明菌群多样性非常高
- 物种丰富度：1622个物种
**关键发现：**
- 检出 12 种潜在病原体，需重点关注
- 菌群多样性良好，微生态平衡
- 优势菌为常驻菌群（Prevotella属），总体正常
|
JXEY07A002
|
overview
|
basic
|
[
"Prevotella melaninogenica (5.7%)",
"Streptococcus salivarius (4.4%)",
"Veillonella dispar (4.3%)"
] |
针对此微生物检测结果，应该采取什么治疗策略？
|
样本ID: ZYQC03-A056
|
治疗策略建议：
**一、主要关注病原体**
- Escherichia coli（大肠杆菌）- 风险等级：variable
- Aggregatibacter actinomycetemcomitans（伴放线放线杆菌）- 风险等级：medium
- Legionella pneumophila（嗜肺军团菌）- 风险等级：high
**二、经验性抗菌治疗建议**
- 以革兰阴性菌为主，首选：三代或四代头孢菌素
- 重症或耐药风险高时：碳青霉烯类
**三、进一步检查建议**
- 药敏试验指导精准用药
- 炎症指标监测（CRP、PCT）
- 必要时重复微生物检测评估疗效
**四、治疗监测要点**
- 48-72小时评估临床反应
- 根据药敏结果降阶梯治疗
- 注意药物不良反应监测
**注意：** 治疗方案需结合患者临床症状、既往用药史及当地耐药流行病学数据综合制定。
|
ZYQC03-A056
|
clinical
|
advanced
|
[
"Escherichia coli",
"Aggregatibacter actinomycetemcomitans",
"Legionella pneumophila"
] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 7077
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Parvularcula marina (25.7%)
- Neospora caninum (24.7%)
- Nesterenkonia natronophila (20.3%)
- Sus scrofa (16.7%)
- Alteribacter natronophilus (6.6%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为1.848，表明菌群多样性中等
- 物种丰富度：71个物种
**关键发现：**
- 菌群多样性偏低，可能存在菌群失调
|
7077
|
overview
|
basic
|
[
"Parvularcula marina (25.7%)",
"Neospora caninum (24.7%)",
"Nesterenkonia natronophila (20.3%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 4791
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：5.74
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.988
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：944种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
4791
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: JXEY05B009
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Prevotella melaninogenica (6.8%)
- Porphyromonas bobii (4.9%)
- Porphyromonas pasteri (4.8%)
- Neisseria subflava (4.2%)
- Streptococcus oralis (3.7%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为4.49，表明菌群多样性非常高
- 物种丰富度：1293个物种
**关键发现：**
- 检出 12 种潜在病原体，需重点关注
- 菌群多样性良好，微生态平衡
- 优势菌为常驻菌群（Prevotella属），总体正常
|
JXEY05B009
|
overview
|
basic
|
[
"Prevotella melaninogenica (6.8%)",
"Porphyromonas bobii (4.9%)",
"Porphyromonas pasteri (4.8%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 3709
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：2.205
多样性中等，菌群结构相对集中
- Simpson指数：0.771
中等均匀度，存在一定优势菌群
- 物种丰富度：216种
**菌群平衡状态评估：**
菌群状态基本正常，持续监测即可。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
3709
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 5342
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Limnohabitans parvus (8.0%)
- Limnohabitans curvus (6.8%)
- Limnohabitans planktonicus (6.3%)
- Limnohabitans radicicola (4.8%)
- Polynucleobacter victoriensis (4.4%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为4.863，表明菌群多样性非常高
- 物种丰富度：849个物种
**关键发现：**
- 菌群多样性良好，微生态平衡
|
5342
|
overview
|
basic
|
[
"Limnohabitans parvus (8.0%)",
"Limnohabitans curvus (6.8%)",
"Limnohabitans planktonicus (6.3%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 7569
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：3.999
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.95
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：367种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
7569
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 785
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：4.415
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.974
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：415种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
785
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 2761
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：4.374
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.975
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：357种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
2761
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 1036
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：0.503
多样性显著降低，提示可能存在明显菌群失调或优势菌过度增殖
- Simpson指数：0.15
优势度高，少数物种占主导地位
- 物种丰富度：135种
**菌群平衡状态评估：**
明显菌群失调，需进一步评估原因并考虑干预。
**可能原因分析：**
- 抗生素使用史
- 免疫功能低下
- 慢性疾病影响
|
1036
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
检测到 Fusobacterium nucleatum，丰度为 0.72%，请评估其临床意义。
|
样本ID: ZYQC07-A024
|
Fusobacterium nucleatum（具核梭杆菌）检测分析：
**1. 病原体特征**
- 检出丰度：0.72%
- 读数：378,678
- 致病类别：oral
- 临床风险等级：medium
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低（<1%），可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状，仍需警惕；若无症状，可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 结合临床症状评估
2. 必要时进行药敏试验
3. 动态监测菌量变化
|
ZYQC07-A024
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Fusobacterium nucleatum"
] |
检测到 Streptococcus pneumoniae，丰度为 0.67%，请评估其临床意义。
|
样本ID: JXEY07E024
|
Streptococcus pneumoniae（肺炎链球菌）检测分析：
**1. 病原体特征**
- 检出丰度：0.67%
- 读数：464,819
- 致病类别：respiratory
- 临床风险等级：high
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低（<1%），可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状，仍需警惕；若无症状，可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 进行药敏试验指导用药
2. 根据感染部位选择合适抗菌方案
3. 密切监测治疗效果
|
JXEY07E024
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Streptococcus pneumoniae"
] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 4381
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Brevundimonas bullata (21.2%)
- Brevundimonas vesicularis (7.4%)
- Janthinobacterium tructae (4.2%)
- Brevundimonas diminuta (3.7%)
- Sphingomonas melonis (3.3%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为4.017，表明菌群多样性非常高
- 物种丰富度：811个物种
**关键发现：**
- 菌群多样性良好，微生态平衡
|
4381
|
overview
|
basic
|
[
"Brevundimonas bullata (21.2%)",
"Brevundimonas vesicularis (7.4%)",
"Janthinobacterium tructae (4.2%)"
] |
请分析样本 7352 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 7352
|
根据样本 7352 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：42,186,826
- 检出物种数：499
- Shannon多样性指数：2.097
- Simpson多样性指数：0.778
**二、优势菌群**
- Ligilactobacillus salivarius (33.2%)
- Ligilactobacillus animalis (28.3%)
- Streptococcus alactolyticus (16.6%)
- Clostridium perfringens (5.3%)
- Ligilactobacillus agilis (2.1%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性处于正常范围，建议定期监测。
|
7352
|
overview
|
basic
|
[
"Ligilactobacillus salivarius (33.2%)",
"Ligilactobacillus animalis (28.3%)",
"Streptococcus alactolyticus (16.6%)"
] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 6366
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Frischella perrara (21.2%)
- Apis mellifera (14.6%)
- Gilliamella apicola (12.1%)
- Lactobacillus apis (10.0%)
- Gilliamella apis (7.3%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为2.608，表明菌群多样性良好
- 物种丰富度：103个物种
**关键发现：**
- 无特殊发现
|
6366
|
overview
|
basic
|
[
"Frischella perrara (21.2%)",
"Apis mellifera (14.6%)",
"Gilliamella apicola (12.1%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: NTC20250120-2
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：1.405
多样性显著降低，提示可能存在明显菌群失调或优势菌过度增殖
- Simpson指数：0.435
优势度高，少数物种占主导地位
- 物种丰富度：227种
**菌群平衡状态评估：**
存在菌群失调迹象，检出病原体可能为失调相关。
**可能原因分析：**
- 抗生素使用史
- 免疫功能低下
- 慢性疾病影响
- 急性感染状态
|
NTC20250120-2
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
检测到 Fusobacterium nucleatum，丰度为 0.95%，请评估其临床意义。
|
样本ID: ZYYH02-A003
|
Fusobacterium nucleatum（具核梭杆菌）检测分析：
**1. 病原体特征**
- 检出丰度：0.95%
- 读数：701,761
- 致病类别：oral
- 临床风险等级：medium
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低（<1%），可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状，仍需警惕；若无症状，可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 结合临床症状评估
2. 必要时进行药敏试验
3. 动态监测菌量变化
|
ZYYH02-A003
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Fusobacterium nucleatum"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: ZYZJ04-A004
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：5.055
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.987
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：1402种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 急性感染状态
|
ZYZJ04-A004
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
请分析样本 ZYQC05-H003 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: ZYQC05-H003
|
根据样本 ZYQC05-H003 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：62,109,605
- 检出物种数：994
- Shannon多样性指数：4.51
- Simpson多样性指数：0.976
**二、优势菌群**
- Streptococcus mitis (7.2%)
- Nocardioides agariphilus (5.8%)
- Gemella haemolysans (5.4%)
- Lysobacter prati (5.2%)
- Streptococcus oralis (4.8%)
**三、检出病原体情况**
检出 9 种潜在病原体：
- Streptococcus pneumoniae
- Fusobacterium nucleatum
- Neisseria meningitidis
- Campylobacter concisus
- Prevotella intermedia
- Tannerella forsythia
- Porphyromonas gingivalis
- Treponema denticola
- Cutibacterium acnes
**四、总体评估**
菌群多样性良好，微生态状态相对健康。
|
ZYQC05-H003
|
overview
|
basic
|
[
"Streptococcus mitis (7.2%)",
"Nocardioides agariphilus (5.8%)",
"Gemella haemolysans (5.4%)"
] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 5371
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Bradyrhizobium erythrophlei (5.1%)
- Arthrobacter ramosus (3.8%)
- Rhodanobacter panaciterrae (3.4%)
- Paraburkholderia caffeinilytica (3.0%)
- Paraburkholderia madseniana (2.4%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为5.226，表明菌群多样性非常高
- 物种丰富度：452个物种
**关键发现：**
- 菌群多样性良好，微生态平衡
|
5371
|
overview
|
basic
|
[
"Bradyrhizobium erythrophlei (5.1%)",
"Arthrobacter ramosus (3.8%)",
"Rhodanobacter panaciterrae (3.4%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 4274
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：2.762
多样性良好，菌群结构相对平衡
- Simpson指数：0.845
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：341种
**菌群平衡状态评估：**
菌群状态基本正常，持续监测即可。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
4274
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
请分析样本 3440 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 3440
|
根据样本 3440 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：21,179,318
- 检出物种数：300
- Shannon多样性指数：2.272
- Simpson多样性指数：0.735
**二、优势菌群**
- Phocaeicola vulgatus (48.4%)
- Bacteroides xylanisolvens (13.1%)
- Phocaeicola dorei (10.2%)
- Bacteroides ovatus (3.0%)
- Phocaeicola sartorii (2.5%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性处于正常范围，建议定期监测。
|
3440
|
overview
|
basic
|
[
"Phocaeicola vulgatus (48.4%)",
"Bacteroides xylanisolvens (13.1%)",
"Phocaeicola dorei (10.2%)"
] |
检测到 Streptococcus pneumoniae，丰度为 0.30%，请评估其临床意义。
|
样本ID: ZYQC02-A013
|
Streptococcus pneumoniae（肺炎链球菌）检测分析：
**1. 病原体特征**
- 检出丰度：0.30%
- 读数：124,117
- 致病类别：respiratory
- 临床风险等级：high
**2. 临床意义评估**
该菌丰度较低（<1%），可能为低水平定植或过路菌。若患者有相关症状，仍需警惕；若无症状，可随访观察。
**3. 建议措施**
1. 进行药敏试验指导用药
2. 根据感染部位选择合适抗菌方案
3. 密切监测治疗效果
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ZYQC02-A013
|
pathogen
|
intermediate
|
[
"Streptococcus pneumoniae"
] |
请分析样本 7080 的微生物检测结果概况。
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样本ID: 7080
|
根据样本 7080 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：1,462,294
- 检出物种数：69
- Shannon多样性指数：1.872
- Simpson多样性指数：0.794
**二、优势菌群**
- Parvularcula marina (29.4%)
- Nesterenkonia natronophila (25.2%)
- Neospora caninum (20.0%)
- Sus scrofa (10.8%)
- Alteribacter natronophilus (5.2%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性处于正常范围，建议定期监测。
|
7080
|
overview
|
basic
|
[
"Parvularcula marina (29.4%)",
"Nesterenkonia natronophila (25.2%)",
"Neospora caninum (20.0%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: JXEY06C002
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：4.37
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.957
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：1335种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 急性感染状态
|
JXEY06C002
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 3706
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：3.021
多样性良好，菌群结构相对平衡
- Simpson指数：0.876
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：251种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
3706
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 7620
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：3.451
多样性良好，菌群结构相对平衡
- Simpson指数：0.916
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：245种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
7620
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: ZYYH02-A013
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Rothia mucilaginosa (4.4%)
- Veillonella rogosae (3.0%)
- Fusobacterium pseudoperiodonticum (2.6%)
- Streptococcus mitis (2.2%)
- Prevotella melaninogenica (2.2%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为5.17，表明菌群多样性非常高
- 物种丰富度：1401个物种
**关键发现：**
- 检出 11 种潜在病原体，需重点关注
- 菌群多样性良好，微生态平衡
- 优势菌为常驻菌群（Rothia属），总体正常
|
ZYYH02-A013
|
overview
|
basic
|
[
"Rothia mucilaginosa (4.4%)",
"Veillonella rogosae (3.0%)",
"Fusobacterium pseudoperiodonticum (2.6%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 2865
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：3.629
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.931
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：371种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
2865
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 4496
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Pseudomonas yamanorum (33.9%)
- Pseudomonas fluorescens (4.7%)
- Rhodococcus qingshengii (3.9%)
- Nitrosopumilus oxyclinae (1.8%)
- Pseudomonas azotoformans (1.6%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为4.744，表明菌群多样性非常高
- 物种丰富度：2594个物种
**关键发现：**
- 菌群多样性良好，微生态平衡
- 优势菌含潜在致病属（Pseudomonas），需警惕
|
4496
|
overview
|
basic
|
[
"Pseudomonas yamanorum (33.9%)",
"Pseudomonas fluorescens (4.7%)",
"Rhodococcus qingshengii (3.9%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 1859
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：3.387
多样性良好，菌群结构相对平衡
- Simpson指数：0.892
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：342种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
1859
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: ZYQC06-A038
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：5.069
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.988
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：1253种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 急性感染状态
|
ZYQC06-A038
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 235
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Klebsiella oxytoca (94.8%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为0.398，表明菌群多样性较低
- 物种丰富度：355个物种
**关键发现：**
- 菌群多样性偏低，可能存在菌群失调
- 优势菌含潜在致病属（Klebsiella），需警惕
|
235
|
overview
|
basic
|
[
"Klebsiella oxytoca (94.8%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 1101
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：3.881
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.957
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：387种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
1101
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 2159
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：4.092
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.964
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：490种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
2159
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 3447
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：2.818
多样性良好，菌群结构相对平衡
- Simpson指数：0.835
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：298种
**菌群平衡状态评估：**
菌群状态基本正常，持续监测即可。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
3447
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
针对此微生物检测结果，应该采取什么治疗策略？
|
样本ID: PTC20250211-2
|
治疗策略建议：
**一、主要关注病原体**
- Staphylococcus aureus（金黄色葡萄球菌）- 风险等级：high
**二、经验性抗菌治疗建议**
- 以革兰阳性菌为主，首选：万古霉素或利奈唑胺（疑似MRSA时）
- 非耐药菌可选：苯唑西林或头孢唑林
**三、进一步检查建议**
- 药敏试验指导精准用药
- 炎症指标监测（CRP、PCT）
- 必要时重复微生物检测评估疗效
**四、治疗监测要点**
- 48-72小时评估临床反应
- 根据药敏结果降阶梯治疗
- 注意药物不良反应监测
**注意：** 治疗方案需结合患者临床症状、既往用药史及当地耐药流行病学数据综合制定。
|
PTC20250211-2
|
clinical
|
advanced
|
[
"Staphylococcus aureus"
] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 7641
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Succiniclasticum ruminis (13.8%)
- Prevotella ruminicola (12.6%)
- Prevotella aff. ruminicola Tc2-24 (6.1%)
- Prevotella brevis (5.4%)
- Sharpea azabuensis (5.3%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为3.939，表明菌群多样性非常高
- 物种丰富度：284个物种
**关键发现：**
- 菌群多样性良好，微生态平衡
|
7641
|
overview
|
basic
|
[
"Succiniclasticum ruminis (13.8%)",
"Prevotella ruminicola (12.6%)",
"Prevotella aff. ruminicola Tc2-24 (6.1%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 2949
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：2.735
多样性良好，菌群结构相对平衡
- Simpson指数：0.855
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：293种
**菌群平衡状态评估：**
菌群状态基本正常，持续监测即可。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
2949
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 676
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Alistipes onderdonkii (9.3%)
- Faecalibacterium prausnitzii (7.2%)
- Ruminococcus bicirculans (4.8%)
- Hominimerdicola aceti (4.7%)
- Faecalibacterium duncaniae (4.2%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为4.497，表明菌群多样性非常高
- 物种丰富度：648个物种
**关键发现：**
- 菌群多样性良好，微生态平衡
|
676
|
overview
|
basic
|
[
"Alistipes onderdonkii (9.3%)",
"Faecalibacterium prausnitzii (7.2%)",
"Ruminococcus bicirculans (4.8%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: ZYQC06-A046
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：3.795
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.966
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：830种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 急性感染状态
|
ZYQC06-A046
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
请分析样本 4510 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 4510
|
根据样本 4510 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：2,067,834
- 检出物种数：873
- Shannon多样性指数：5.745
- Simpson多样性指数：0.991
**二、优势菌群**
- Thermomonas carbonis (5.9%)
- Nitrospira defluvii (3.7%)
- Vitreimonas flagellata (2.0%)
- Lacunisphaera limnophila (1.6%)
- Thermomonas aquatica (1.6%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性良好，微生态状态相对健康。
|
4510
|
overview
|
basic
|
[
"Thermomonas carbonis (5.9%)",
"Nitrospira defluvii (3.7%)",
"Vitreimonas flagellata (2.0%)"
] |
请分析样本 ZYQC06-A013 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: ZYQC06-A013
|
根据样本 ZYQC06-A013 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：51,240,393
- 检出物种数：1239
- Shannon多样性指数：4.936
- Simpson多样性指数：0.985
**二、优势菌群**
- Nocardioides agariphilus (5.3%)
- Lysobacter prati (4.6%)
- Prevotella melaninogenica (4.5%)
- Ramlibacter humi (3.1%)
- Gluconacetobacter azotocaptans (3.0%)
**三、检出病原体情况**
检出 12 种潜在病原体：
- Fusobacterium nucleatum
- Campylobacter concisus
- Prevotella intermedia
- Streptococcus pneumoniae
- Treponema denticola
- Tannerella forsythia
- Neisseria meningitidis
- Porphyromonas gingivalis
- Staphylococcus aureus
- Aggregatibacter actinomycetemcomitans
- Cutibacterium acnes
- Enterococcus faecalis
**四、总体评估**
菌群多样性良好，微生态状态相对健康。
|
ZYQC06-A013
|
overview
|
basic
|
[
"Nocardioides agariphilus (5.3%)",
"Lysobacter prati (4.6%)",
"Prevotella melaninogenica (4.5%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 5047
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：5.376
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.984
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：1247种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
5047
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
请分析样本 4865 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 4865
|
根据样本 4865 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：493,623
- 检出物种数：520
- Shannon多样性指数：4.847
- Simpson多样性指数：0.97
**二、优势菌群**
- Cutibacterium acnes (12.7%)
- Kocuria indica (7.0%)
- Pan troglodytes (4.2%)
- Micrococcus yunnanensis (3.7%)
- Ustilago hordei (3.7%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性良好，微生态状态相对健康。
|
4865
|
overview
|
basic
|
[
"Cutibacterium acnes (12.7%)",
"Kocuria indica (7.0%)",
"Pan troglodytes (4.2%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 2019
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：3.946
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.95
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：300种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 当前无明显异常因素
|
2019
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
请分析样本 5869 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 5869
|
根据样本 5869 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：2,179,291
- 检出物种数：412
- Shannon多样性指数：5.33
- Simpson多样性指数：0.992
**二、优势菌群**
- Ornithinibacter aureus (3.1%)
- Polaromonas glacialis (2.6%)
- Thiobacillus thioparus (2.5%)
- Cryobacterium breve (2.1%)
- Aquincola rivuli (2.0%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性良好，微生态状态相对健康。
|
5869
|
overview
|
basic
|
[
"Ornithinibacter aureus (3.1%)",
"Polaromonas glacialis (2.6%)",
"Thiobacillus thioparus (2.5%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: 7162
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：1.867
多样性中等，菌群结构相对集中
- Simpson指数：0.816
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：44种
**菌群平衡状态评估：**
菌群状态基本正常，持续监测即可。
**可能原因分析：**
- 抗生素使用史
- 免疫功能低下
- 慢性疾病影响
|
7162
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
请分析样本 JXEY04A036 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: JXEY04A036
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根据样本 JXEY04A036 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：67,742,314
- 检出物种数：1144
- Shannon多样性指数：4.595
- Simpson多样性指数：0.979
**二、优势菌群**
- Streptococcus mitis (7.3%)
- Streptococcus salivarius (5.0%)
- Streptococcus oralis (4.6%)
- Veillonella atypica (4.0%)
- Veillonella nakazawae (3.7%)
**三、检出病原体情况**
检出 11 种潜在病原体：
- Streptococcus pneumoniae
- Campylobacter concisus
- Fusobacterium nucleatum
- Neisseria meningitidis
- Tannerella forsythia
- Enterococcus faecium
- Enterococcus faecalis
- Porphyromonas gingivalis
- Aggregatibacter actinomycetemcomitans
- Cutibacterium acnes
- Treponema denticola
**四、总体评估**
菌群多样性良好，微生态状态相对健康。
|
JXEY04A036
|
overview
|
basic
|
[
"Streptococcus mitis (7.3%)",
"Streptococcus salivarius (5.0%)",
"Streptococcus oralis (4.6%)"
] |
该样本的菌群多样性指标表明什么？是否存在菌群失调？
|
样本ID: JXEY06A017
|
菌群多样性分析：
**多样性指标解读：**
- Shannon指数：4.584
多样性非常高，菌群结构均匀
- Simpson指数：0.978
均匀度高，物种分布较为均衡
- 物种丰富度：1182种
**菌群平衡状态评估：**
菌群平衡状态良好，微生态环境健康。
**可能原因分析：**
- 急性感染状态
|
JXEY06A017
|
interpretation
|
intermediate
|
[] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 4374
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Methylobacter tundripaludum (38.8%)
- Hydrogenophaga aromaticivorans (9.3%)
- Hydrogenophaga taeniospiralis (9.0%)
- Methylotenera versatilis (7.6%)
- Hydrogenophaga pseudoflava (3.0%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为2.951，表明菌群多样性良好
- 物种丰富度：397个物种
**关键发现：**
- 无特殊发现
|
4374
|
overview
|
basic
|
[
"Methylobacter tundripaludum (38.8%)",
"Hydrogenophaga aromaticivorans (9.3%)",
"Hydrogenophaga taeniospiralis (9.0%)"
] |
请分析样本 7675 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 7675
|
根据样本 7675 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：1,519,099
- 检出物种数：143
- Shannon多样性指数：3.068
- Simpson多样性指数：0.903
**二、优势菌群**
- Akkermansia muciniphila (19.6%)
- Lactococcus intestinalis (14.4%)
- Lactococcus lactis (13.7%)
- Lactobacillus johnsonii (11.5%)
- Mus musculus (3.7%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性良好，微生态状态相对健康。
|
7675
|
overview
|
basic
|
[
"Akkermansia muciniphila (19.6%)",
"Lactococcus intestinalis (14.4%)",
"Lactococcus lactis (13.7%)"
] |
请分析样本 2113 的微生物检测结果概况。
|
样本ID: 2113
|
根据样本 2113 的微生物检测结果分析：
**一、样本基本信息**
- 总测序读数：20,985,746
- 检出物种数：437
- Shannon多样性指数：3.689
- Simpson多样性指数：0.938
**二、优势菌群**
- Prevotella copri (17.3%)
- Prevotellamassilia timonensis (11.4%)
- Prevotella hominis (8.8%)
- Shigella flexneri (4.8%)
- Lactococcus garvieae (3.7%)
**三、检出病原体情况**
未检出明显致病菌
**四、总体评估**
菌群多样性良好，微生态状态相对健康。
|
2113
|
overview
|
basic
|
[
"Prevotella copri (17.3%)",
"Prevotellamassilia timonensis (11.4%)",
"Prevotella hominis (8.8%)"
] |
该样本的主要微生物组成是什么？有哪些值得关注的发现？
|
样本ID: 6782
|
样本微生物组成分析：
**主要菌群组成：**
- Parvularcula marina (19.7%)
- Nesterenkonia natronophila (14.7%)
- Neospora caninum (11.9%)
- Anoxybacillus flavithermus (9.7%)
- Anoxybacillus karvacharensis (7.1%)
**多样性评估：**
- Shannon指数为3.161，表明菌群多样性良好
- 物种丰富度：397个物种
**关键发现：**
- 菌群多样性良好，微生态平衡
|
6782
|
overview
|
basic
|
[
"Parvularcula marina (19.7%)",
"Nesterenkonia natronophila (14.7%)",
"Neospora caninum (11.9%)"
] |
Subsets and Splits
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